本文選題：綿羊 + Lpin基因�。� 參考：《中國畜牧雜志》2017年04期

【摘要】：本研究應(yīng)用RT-PCR、5'-RACE、TA克隆技術(shù)獲得綿羊Lpin2基因CDS區(qū),并進(jìn)行相關(guān)生物信息學(xué)分析,為其遺傳特性及編碼蛋白功能機(jī)制的研究提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。結(jié)果獲得綿羊Lpin2基因2 754 bp,包括84 bp的5'UTR和2 670 bp的CDS區(qū),編碼889個氨基酸。生物信息學(xué)分析編碼蛋白lipin2屬不穩(wěn)定的中性親水脂溶性蛋白,存在跨膜域、2個O-糖基化位點和89個磷酸化位點,沒有信號肽,定位于細(xì)胞質(zhì)或細(xì)胞器中。存在由細(xì)胞質(zhì)活性氧(ROS)主導(dǎo)的氧化還原機(jī)制形成的二硫鍵。二級結(jié)構(gòu)包含高比例的環(huán)(80.54%)。蛋白N-末端和C-末端分別含有保守結(jié)構(gòu)域Lipin_N和LSN2。綿羊與山羊、家牛、羊駝、豬、家犬、靈長類與嚙齒類動物以及原雞lipin2氨基酸序列同源,系統(tǒng)進(jìn)化與其親緣關(guān)系遠(yuǎn)近一致,Lpin2基因編碼區(qū)進(jìn)化保守。綿羊lipin2與lipin1氨基酸序列相似性相對較低(66%),可能與其有差異的功能活性有關(guān)。
[Abstract]:In this study, the CDS region of sheep Lpin2 gene was obtained by RT-PCR5 + -RACETA cloning technique, and the related bioinformatics analysis was carried out to provide basic data for the study of genetic characteristics and functional mechanism of encoding protein. Results the sheep Lpin2 gene was obtained, including 84 BP 5'UTR and 2 670 BP CDS region, encoding 889 amino acids. Bioinformatics analysis showed that the encoded protein lipin2 was an unstable neutral hydrophilic lipophilic protein with transmembrane domain, two O-glycosylation sites and 89 phosphorylation sites, with no signal peptide and located in the cytoplasm or organelle. There is a disulfide bond formed by redox mechanism dominated by cytoplasmic reactive oxygen species (Ros). The secondary structure contains a high ratio of 80. 54 rings. Protein N-terminal and C-terminal contain conserved domain Lipin_N and LSN2, respectively. Sheep and goat, domestic cattle, alpaca, pig, dog, primate and rodent, and proto-chicken lipin2 amino acid sequence are homologous, and the phylogenetic relationship of Lpin2 gene is conserved. The amino acid sequence similarity between lipin2 and lipin1 in sheep is relatively low, which may be related to its different functional activity.
【作者單位】： 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院;天津農(nóng)學(xué)院動物科學(xué)與動物醫(yī)學(xué)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31372292)
【分類號】：S826.2

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【共引文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號：1847278