發(fā)布時(shí)間：2018-05-02 05:25

  本文選題：馬鹿 + Y染色體�。� 參考：《吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)》2016年碩士論文

【摘要】：馬鹿是我國重要的茸鹿資源,野生數(shù)量急劇下降,在我國新疆、東北和內(nèi)蒙古等地均有飼養(yǎng)。本研究利用Y染色體基因片段對8個(gè)馬鹿群體共345個(gè)個(gè)體的約8900bp基因片段進(jìn)行了研究,分析了馬鹿Y染色體的單倍型多樣性、馬鹿的群體遺傳多樣性,探討馬鹿群體的父系起源。結(jié)果如下:8個(gè)馬鹿群體Y染色體AMELY、DBY、SRY、ZFY基因擴(kuò)增片段總長約為8900bp,8個(gè)馬鹿群體具有相似的堿基組成,A+T堿基含量為64.8%~64.9%,G+C堿基含量為35.1%~35.2%。赤鹿和清原馬鹿核酸歧異度最大(Dxy=0.00386);清原馬鹿和天山馬鹿核酸歧異度最小(Dxy=0.00047)。赤鹿具有最高的核苷酸多樣性(π=0.00177),其次為塔河馬鹿(π=0.00176)。赤鹿與其他馬鹿群體間遺傳距離均最大(D=0.004)發(fā)現(xiàn)了85個(gè)變異位點(diǎn),其中,在2334、3284、3680、5110等位置處出現(xiàn)了A-C互換,在160、340、671、4694、6086、7267等位置處出現(xiàn)了A-G互換,在563、625、726、965、2216、2957、5090、5469、8605等位置處出現(xiàn)了C-T互換,在3197、6844等位置處出現(xiàn)了G-T互換,在428、1195等位置處出現(xiàn)了A-T顛換,在984等位置處出現(xiàn)缺失。39個(gè)單倍型被定義。東北馬鹿存在7個(gè)單倍型,塔河馬鹿存在9個(gè)單倍型,阿爾泰馬鹿存在9個(gè)單倍型,天山馬鹿存在6個(gè)單倍型,甘肅馬鹿存在4個(gè)單倍型,青海馬鹿存在3個(gè)單倍型,清原馬鹿存在17個(gè)單倍型,赤鹿具有6個(gè)單倍型。單倍型1、3、8、15、34為優(yōu)勢單倍型。單倍型1、3、8、15為幾個(gè)群體間的共有單倍型,單倍型8、12、13為塔河馬鹿與清原馬鹿共有,單倍型14、15、16為甘肅馬鹿與青海馬鹿共有,單倍型34為赤鹿獨(dú)有。利用Mega 6.0軟件對所得到的AMELY、DBY、SRY、ZFY基因片段序列進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),AMELY基因片段存在的變異位點(diǎn)最多47個(gè),單倍型多樣性最豐富,而DBY、SRY、ZFY基因片段存在變異位點(diǎn)相對較少。將所得到Y(jié)染色體基因片段進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)了85個(gè)變異位點(diǎn),定義了39個(gè)單倍型。其中,塔河馬鹿、清原馬鹿,赤鹿均具有自己獨(dú)特的單倍型;塔河和清原兩種馬鹿之間存在共有單倍型,甘肅和青海兩個(gè)馬鹿之間存在共享單倍型。構(gòu)建NJ和ML分子系統(tǒng)發(fā)育樹發(fā)現(xiàn)這八個(gè)馬鹿群體共存在5個(gè)分支,青海馬鹿、清原馬鹿、阿爾泰馬鹿、甘肅馬鹿、塔河馬鹿、東北馬鹿、天山馬鹿聚為一類;構(gòu)成支系Ⅰ和支系Ⅱ。甘肅馬鹿和青海馬鹿聚為支系Ⅲ,塔河馬鹿與清原馬鹿聚為支系Ⅳ,赤鹿聚為支系Ⅴ。赤鹿自成一系與其他馬鹿群體間不存在基因交流;塔河馬鹿、甘肅馬鹿與其他馬鹿之間可能存在基因交流。利用Y染色體的不同基因片段分別分析馬鹿群體的遺傳多樣性,關(guān)于馬鹿群體間的遺傳距離AMELY、SRY、ZFY 3個(gè)基因片段的結(jié)果相一致,赤鹿與其他種群間差異明顯。而DBY基因的結(jié)果略有差異,塔河馬鹿與其余馬鹿間的遺傳距離較大,其他馬鹿間的遺傳距離均較近,差異不明顯,塔河馬鹿與其他種群間差異明顯。為更準(zhǔn)確的描述8個(gè)馬鹿群體間的遺傳關(guān)系,將4個(gè)Y染色體基因片段序列整合在一起,結(jié)果顯示赤鹿與其他馬鹿群體間遺傳距離相對較遠(yuǎn),而其他馬鹿群體間的遺傳距離較近,赤鹿具有最高的核苷酸多樣性,其次為塔河馬鹿,該結(jié)果同時(shí)也是對單基因分析結(jié)果的綜合,由此認(rèn)為多基因片段綜合分析的結(jié)果更為準(zhǔn)確。利用Y染色體基因探討了塔河馬鹿單倍型特性并研究其與產(chǎn)茸性狀之間的關(guān)系,對Y染色體AMELY、DBY、SRY、ZFY基因片段進(jìn)行了分析,AMELY基因定義了5個(gè)單倍型;DBY基因共定義了5個(gè)單倍型,SRY基因定義了2個(gè)單倍型,ZFY基因定義了4個(gè)單倍型。利用SAS9.3軟件分析單倍型與產(chǎn)茸量之間的關(guān)系:發(fā)現(xiàn)ZFY基因?qū)Ξa(chǎn)茸性狀有一定的影響(P0.2),其中單倍型2和單倍型3的影響顯著。
[Abstract]:The results were as follows : A - C exchange was found at positions of 3,193,625 , 726 , 965 , 2216 , 2957 , 5090 , 5469 and 8605 . The genetic diversity of the deer population was analyzed by using different gene fragments of Y chromosome . The genetic distance between the two deer populations was quite different . The results showed that the genetic distance between the red deer and the other deer populations was relatively large . The results showed that the genetic distance between the two deer populations was relatively large .

【學(xué)位授予單位】：吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S825

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本文編號：1832536