本文選題：基因表達(dá)譜 + 差異表達(dá)基因��； 參考：《數(shù)學(xué)的實(shí)踐與認(rèn)識(shí)》2016年18期

【摘要】：提出一種基于基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)篩選差異表達(dá)基因的新方法;介紹了篩選差異表達(dá)基因常見(jiàn)方法-錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率方法(False Discovery Rate,FDR,),分析了多重假設(shè)檢驗(yàn)p值性質(zhì),并根據(jù)p值性質(zhì)提出了一種篩選差異表達(dá)基因新方法-單位γ度量法(Unit Measure-γ,UM-γ),建立了計(jì)算機(jī)模擬基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)模型,制定了假陰性率、假陽(yáng)性率、靈敏度、特異度以及總體錯(cuò)誤率等作為考核指標(biāo),并使用基因表達(dá)譜模擬數(shù)據(jù)進(jìn)行計(jì)算、比較;單位γ度量法估計(jì)非差異表達(dá)基因個(gè)數(shù)具有較高的穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性;單位γ度量法既能夠同時(shí)控制假陽(yáng)性、假陰性以及總體錯(cuò)事件的發(fā)生,又能在一定程度上提高篩選結(jié)果的靈敏度和變異度;新提出的方法能有效、準(zhǔn)確且穩(wěn)定的對(duì)模擬數(shù)據(jù)差異表達(dá)基因進(jìn)行篩選.
[Abstract]:A new method for screening differentially expressed genes based on gene expression data was proposed, and the common method of screening differential expression genes, False Discovery Rate (FDR), was introduced. The properties of P value of multiple hypothesis testing were analyzed, and a new method of screening differential expression genes, unit gamma measurement (Unit), based on the properties of P value (Unit), was proposed. Measure- gamma, UM- gamma), a computer simulated gene expression profile data model was established, and the false negative rate, false positive rate, sensitivity, specificity and total error rate were used as evaluation indexes, and the number of non differentially expressed genes was estimated by the unit gamma ray method. And accuracy; unit gamma measurement can not only control false positive, false negative and overall wrong events simultaneously, but also improve the sensitivity and variability of the screening results to a certain extent. The new method can be effective, accurate and stable for screening the differential expression basis of simulated data.

【作者單位】： 南京醫(yī)科大學(xué)附屬南京醫(yī)院醫(yī)療設(shè)備處;南京醫(yī)科大學(xué)數(shù)學(xué)與計(jì)算機(jī)系;南京醫(yī)科大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程系;青島理工大學(xué)土木工程系;
【基金】：南京醫(yī)科大學(xué)科技發(fā)展基金面上項(xiàng)目(NJMU20150035)
【分類號(hào)】：Q811.4

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本文編號(hào)：1829510