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三重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)水產(chǎn)動(dòng)物源細(xì)菌磺胺類耐藥基因

發(fā)布時(shí)間:2018-04-29 01:21

  本文選題:水產(chǎn)動(dòng)物源細(xì)菌 + 磺胺類耐藥基因 ; 參考:《湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)》2017年01期


【摘要】:根據(jù)Gen Bank中細(xì)菌磺胺類耐藥基因Sul1、Sul2和Sul3的保守序列設(shè)計(jì)3對(duì)特異性引物及相應(yīng)Taq Man探針,以重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品為模板對(duì)反應(yīng)條件進(jìn)行優(yōu)化,建立一種可同時(shí)檢測(cè)上述3種耐藥基因的三重?zé)晒舛縋CR方法,并對(duì)該方法進(jìn)行敏感性、特異性、重復(fù)性及臨床菌株檢測(cè)試驗(yàn)。結(jié)果表明:該方法定量范圍為1×10~1~1×10~8拷貝/反應(yīng)時(shí),其標(biāo)準(zhǔn)曲線呈良好的線性關(guān)系;該方法靈敏度高(3個(gè)基因的最低質(zhì)粒檢測(cè)限均可達(dá)到10拷貝/反應(yīng))、特異性強(qiáng)(與其他病原菌及病毒無(wú)交叉反應(yīng))、重復(fù)性好(變異系數(shù)均小于2%);對(duì)臨床菌株的檢測(cè)結(jié)果與藥敏試驗(yàn)結(jié)果的符合率達(dá)94.2%,且整個(gè)檢測(cè)過(guò)程可在2 h內(nèi)完成。所建立的可同時(shí)檢測(cè)Sul1、Sul2和Sul3基因的三重?zé)晒舛縋CR方法可用于臨床檢測(cè)細(xì)菌的磺胺類耐藥基因。
[Abstract]:Three pairs of specific primers and corresponding Taq Man probes were designed according to the conserved sequences of sulfamethylamine Sulfur2 and Sul3 in Gen Bank, and the reaction conditions were optimized by using the standard plasmid as template. A triple fluorescence quantitative PCR method was developed for the simultaneous detection of the three drug resistant genes, and the sensitivity, specificity, reproducibility and clinical strains were tested. The results showed that the standard curve showed a good linear relationship when the quantitative range of the method was 1 脳 10 ~ (-1) ~ 1 脳 10 ~ (8) copy / reaction. This method has high sensitivity (the lowest plasmid detection limit of three genes can be up to 10 copies / reaction), strong specificity (no cross reaction with other pathogens and viruses, good reproducibility (coefficient of variation less than 2%), and detection of clinical strains The coincidence rate between the test results and the drug sensitivity test results was 94.2%, and the whole detection process could be completed within 2 hours. The triplex fluorescence quantitative PCR method for simultaneous detection of Sul1-Sul2 and Sul3 genes can be used in clinical detection of sulfanilamide-resistant genes in bacteria.
【作者單位】: 廣西水產(chǎn)科學(xué)研究院;
【基金】:廣西水產(chǎn)畜牧科技項(xiàng)目(桂漁牧科201528044) 廣西科技攻關(guān)項(xiàng)目(桂科攻1355010 3)
【分類號(hào)】:S941.4

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2 王佳Z,

本文編號(hào):1817759


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