本文選題：ATP合酶g亞基 + 淡色庫蚊�。� 參考：《中國病原生物學雜志》2017年08期

【摘要】：目的克隆淡色庫蚊(Culex pipiens pallens)ATP合酶g亞基基因編碼區(qū)序列并進行生物信息學分析,比較其在溴氰菊酯抗性品系和敏感品系中的表達方法利用PCR方法擴增ATP合酶g亞基基因編碼區(qū)序列。利用生物信息學分析工具,預測ATP合酶g亞基基因編碼蛋白的理化性質、蛋白結構域、跨膜區(qū)、信號肽和亞細胞定位;對淡色庫蚊和其他物種的ATP合酶g亞基進行氨基酸序列多重比對,并構建系統(tǒng)發(fā)育樹。通過實時定量PCR檢測比較ATP合酶g亞基基因在淡色庫蚊溴氰菊酯敏感品系和抗性品系中的表達。結果克隆出長306bp的淡色庫蚊ATP合酶g亞基基因編碼區(qū)序列(GenBank登錄號:KY783435),該基因編碼101個氨基酸。生物信息學分析ATP合酶g亞基基因編碼蛋白理論分子質量單位(Mr)為11×10~3,等電點為9.56,在第6-98位氨基酸具有ATP合酶g亞基結構域,未發(fā)現(xiàn)信號肽和跨膜區(qū),亞細胞定位預測以線粒體表達量最多(占39.1%)。實時定量PCR檢測ATP合酶g亞基基因在淡色庫蚊溴氰菊酯抗性品系中的表達量是敏感品系中表達量的3.14倍。結論獲得淡色庫蚊ATP合酶g亞基基因編碼區(qū)序列,并進行了生物信息學分析,證實該基因在溴氰菊酯抗性品系中高表達。
[Abstract]:Objective to clone the coding region of Culex pipiens pallens)ATP synthase g subunit gene from Culex pipiens pallens and analyze it by bioinformatics. To compare its expression in deltamethrin resistant and sensitive strains, the coding region of ATP synthase g subunit gene was amplified by PCR. The physicochemical properties, protein domain, transmembrane region, signal peptide and subcellular localization of ATP synthase g subunit gene encoding protein were predicted by bioinformatics analysis. Amino acid sequences of ATP synthase g subunits of Culex pipiens pallens and other species were compared and phylogenetic tree was constructed. The expression of ATP synthase g subunit gene in deltamethrin sensitive and resistant strains of Culex pipiens pallens was compared by real-time quantitative PCR. Results the coding region of ATP synthase g subunit gene of Culex pipiens pallens with long 306bp was cloned. The gene encodes 101 amino acids in GenBank accession number: KY783435. Bioinformatics analysis showed that the theoretical molecular weight unit of ATP synthase g gene encoding protein was 11 脳 10 ~ (-3) and the isoelectric point was 9.56. The 6-98 amino acid had ATP synthase g subunit domain, and no signal peptide or transmembrane region was found. Mitochondrial expression was the highest in subcellular localization prediction (39.1%). The expression of ATP synthase g subunit gene in deltamethrin resistant lines of Culex pipiens pallens was 3.14 times higher than that in sensitive strains by real-time quantitative PCR. Conclusion the coding region of ATP synthase g subunit gene of Culex pipiens pallens was obtained and analyzed by bioinformatics. It was confirmed that the gene was overexpressed in deltamethrin resistant lines.
【作者單位】： 保定市第二中心醫(yī)院血液腎病科;河北醫(yī)科大學病原生物學教研室;南京醫(yī)科大學病原生物學系;
【基金】：河北省高等學�？茖W技術研究項目(No.QN2016005)
【分類號】：R384.1

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本文編號：1816869