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麻風(fēng)樹脂肪酸去飽和酶7基因的克隆及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2018-04-25 18:07

  本文選題:麻風(fēng)樹 + 脂肪酸去飽和酶(FAD)。 參考:《江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué)》2017年02期


【摘要】:質(zhì)體型ω-3(Δ15)脂肪酸去飽和酶(FAD7)是多不飽和脂肪酸合成途徑中催化亞油酸(Δ9,12-C18∶2)形成α-亞麻酸(Δ9,12,15-C18∶3,ALA)的關(guān)鍵酶。基于麻風(fēng)樹低溫鍛煉轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),通過逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)技術(shù)克隆到麻風(fēng)樹FAD7基因的全長cDNA,命名為JcFAD7。結(jié)果表明,該cDNA序列全長1 796 bp,完整開放閱讀框1 341 bp,編碼446個氨基酸,理論分子量為51.1 ku,等電點(diǎn)為8.92。序列分析表明,JcFAD7編碼蛋白包含膜結(jié)合FAD蛋白的4個跨膜區(qū)、2個膜嵌合區(qū)、1個亞鐵血紅素結(jié)合基序及3個組氨酸簇等特征區(qū)域。構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,麻風(fēng)樹JcFAD7蛋白與芍藥(Paeonia lactiflora)的親緣關(guān)系最近。
[Abstract]:The plastid type 蠅 -3 (螖 15) fatty acid desaturase (FAD7) is the key enzyme in the synthesis of polyunsaturated fatty acids, which catalyzes the formation of 偽 -linolenic acid (螖 9 ~ (12) -C ~ (18): 2) into 偽 -linolenic acid (螖 _ (12) -C _ (18): 2) in the polyunsaturated fatty acid synthesis pathway. The full-length cDNA of FAD7 gene of Leprosy was cloned by reverse transcription PCR- RT-PCR technique and named JcFAD7 based on the data of hypothermia training transcription group of Leprosy. The results showed that the cDNA sequence was 1 796 BP in length, complete open reading frame 1 341 BP, encoding 446 amino acids. The theoretical molecular weight was 51. 1 ku. the isoelectric point was 8. 92. Sequence analysis showed that the JcFAD7 protein contained four transmembrane regions, two membrane chimeric regions, one heme binding motif and three histidine clusters. The phylogenetic tree showed that JcFAD7 protein was closely related to Paeonia lactiflora.
【作者單位】: 曲靖師范學(xué)院云南高原生物資源保護(hù)與利用研究中心;曲靖師范學(xué)院生物資源與食品工程學(xué)院;云南省高校云貴高原動植物多樣性及生態(tài)適應(yīng)性進(jìn)化重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(編號:31460179)
【分類號】:S794.9

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本文編號:1802395

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