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向日葵V-ATPasea3亞基基因的克隆及表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-04-24 14:43

  本文選題:向日葵 + V-ATPase。 參考:《中國(guó)生物工程雜志》2017年05期


【摘要】:采用RACE技術(shù),從向日葵P50中克隆V-ATPase a3亞基基因c DNA全長(zhǎng),并進(jìn)行生物信息學(xué)分析;利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析不同濃度、不同時(shí)間的Na Cl、ABA和PEG模擬干旱脅迫條件下V-ATPase a3亞基基因的表達(dá)特征,以及相同脅迫條件下該基因在向日葵不同器官的表達(dá)特征。序列分析表明,該基因c DNA全長(zhǎng)2 873bp,含5'-UTR 109bp、3'-UTR 295bp及編碼區(qū)2 469bp,編碼822個(gè)氨基酸,其編碼蛋白質(zhì)的理論分子質(zhì)量為204.55k Da,等電點(diǎn)為6.29,Gen Bank登錄號(hào)為KU315054。該基因編碼的蛋白質(zhì)為疏水性的跨膜蛋白,亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)其在質(zhì)膜上。向日葵V-ATPase a3亞基與已報(bào)道的10種植物的V-ATPase a3亞基的同源蛋白有高度相似的保守區(qū)域,在進(jìn)化上與朝鮮薊的親緣關(guān)系最近。實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果表明,向日葵受到Na Cl、ABA和PEG模擬干旱三種非生物脅迫后,V-ATPase a3亞基基因均上調(diào)表達(dá),但表達(dá)模式不同,不同器官存在特異性表達(dá)差異。研究認(rèn)為,V-ATPase a3亞基基因響應(yīng)了向日葵非生物脅迫的應(yīng)答,為加強(qiáng)對(duì)V-ATPase基因的利用奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:The full length of V-ATPase a3 subunit gene c DNA was cloned from sunflower P50 by RACE technique and analyzed by bioinformatics. The expression characteristics of V-ATPase a3 subunit gene under simulated drought stress at different time and in different organs of sunflower under the same stress condition were studied. Sequence analysis showed that the full length of c DNA was 2873 BP, which contained 5'-UTR 109bpf3 + -UTR 295bp and coding region 2469 BP, encoding 822 amino acids. The theoretical molecular weight of the encoding protein was 204.55k, and the isoelectric point was 6.29gGen Bank accession number was KU315054. The protein encoded by the gene is a hydrophobic transmembrane protein, which is predicted by subcellular localization on the plasma membrane. The V-ATPase a3 subunit of sunflower has a highly conserved region with the homologous protein of V-ATPase a3 subunit of 10 reported plants, and has the closest phylogenetic relationship with artichoke. The results of real-time fluorescence quantitative PCR showed that the gene expression of V-ATPase a3 subunit was up-regulated by NaCl-ABA and PEG under abiotic stress, but the expression pattern was different and the specific expression was different in different organs. It was suggested that the subunit gene of V-ATPase A3 was responsive to abiotic stress of sunflower, which laid a foundation for enhancing the utilization of V-ATPase gene.
【作者單位】: 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院;內(nèi)蒙古農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院;
【基金】:內(nèi)蒙古農(nóng)牧業(yè)創(chuàng)新基金資助項(xiàng)目(2013CXJJN14)
【分類號(hào)】:S565.5

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):1797069

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