本文選題：蝦虎魚科 + S��； 參考：《海洋漁業(yè)》2016年01期

【摘要】：為了確定線粒體16S rRNA基因在長(zhǎng)江口蝦虎魚科魚類系統(tǒng)分類及物種鑒定中的作用,采用16S rRNA基因特異擴(kuò)增測(cè)序及Gen Bank已有序列聯(lián)合配對(duì)分析的方法,對(duì)長(zhǎng)江口蝦虎魚科9屬11種魚類34個(gè)16S rRNA基因片段的序列進(jìn)行比較和系統(tǒng)分類研究。統(tǒng)計(jì)分析顯示,蝦虎魚科魚類該片段的A含量明顯高于其它3個(gè)堿基含量,A+T的平均含量高于G+C的平均含量,第3密碼子位點(diǎn)G+C含量最高,其平均值為51.1%,變化范圍為49.8%~53.2%。全部轉(zhuǎn)換位點(diǎn)多于顛換位點(diǎn),轉(zhuǎn)換/顛換比值為1.45。依據(jù)Maximum Composite Likelihood模型,得出11種蝦虎魚科魚類種間遺傳距離平均值為0.151,種內(nèi)為0.002,種間遺傳距離是種內(nèi)遺傳距離的76倍。通過(guò)鄰接法(Neighbor-joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,顯示長(zhǎng)江口蝦虎魚科魚類為明顯的單系群,并進(jìn)一步佐證把傳統(tǒng)形態(tài)分類中彈涂魚科的青彈涂魚(Scartelaos histiophorus)和大彈涂魚(Boleophthalmus pectinirostris)及鰻蝦虎魚科的拉氏狼牙蝦虎魚(Odontamblyopus lacepedii)和紅狼牙蝦虎魚(Odontamblyopus rubicundus)歸屬于蝦虎魚科的合理性。聚類結(jié)果顯示紅狼牙蝦虎魚和拉氏狼牙蝦虎魚聚在一起,其節(jié)點(diǎn)支持率達(dá)100%,兩者可能為同種異名。本研究表明,線粒體16S rRNA基因序列作為分子標(biāo)記對(duì)蝦虎魚科魚類進(jìn)行物種鑒定和系統(tǒng)分類是可行的,可為蝦虎魚類的親緣關(guān)系分析提供基礎(chǔ)資料。
[Abstract]:In order to determine the role of mitochondrial 16s rRNA gene in the taxonomy and species identification of Shrimp Tiger fishes in the Yangtze River Estuary, the 16s rRNA gene was amplified and sequenced and the existing Gen Bank sequence was combined with pairing analysis. The sequences of 34 16s rRNA gene fragments from 11 species of 11 species belonging to 9 genera in the Yangtze River Estuary were compared and systematically classified. The statistical analysis showed that the A content of this fragment was significantly higher than that of the other three base groups, the average content of AT was higher than that of GC, the content of GC at codon 3 was the highest, the mean value was 51.1, and the range of variation was 49.8% and 53.2%. All the transition sites were more than those on the other hand, the conversion / transversion ratio was 1.45. According to the Maximum Composite Likelihood model, the average genetic distance between species of 11 species was 0.151 and 0.002, and the genetic distance between species was 76 times of that within species. The phylogenetic tree was constructed by Neighbor-joiningnj), which showed that the fishes in the Yangtze River Estuary were monophyletic. The rationality of the traditional morphological classification of Scartelaos histiophorus) and Boleophthalmus pectinirostris (Odontamblyopus laceipedii) and Odontamblyopus rubicundus (Odontamblyopus rubicundus) was further demonstrated. The clustering results showed that the red wolf shrimp tiger and the Lahlus tigfish got together, and the support rate of the nodes reached 100, which may be the same name. The results showed that it was feasible to identify and classify the species of Shrimp Tigronidae by using mitochondrial 16s rRNA gene sequence as a molecular marker, which could provide basic data for the phylogenetic analysis of Shrimp Tiger.
【作者單位】： 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)無(wú)錫漁業(yè)學(xué)院;中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院東海水產(chǎn)研究所;上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院;
【基金】：公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(201203065)
【分類號(hào)】：S917.4

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