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茶樹GGPS基因家族的克

發(fā)布時間:2018-04-23 08:02

  本文選題:茶樹 + r{牛兒基r{牛兒基焦磷酸合酶。 參考:《茶葉科學(xué)》2017年02期


【摘要】:r{牛兒基r{牛兒基焦磷酸合酶(Geranylgeranyl diphosphate synthase,GGPS)是萜類合成途徑的結(jié)構(gòu)酶,對植物生長發(fā)育具有重要意義。本研究通過RACE和RT-PCR方法克隆得到5條潛在的茶樹GGPS序列,分別命名為CsGGPS1-4和CsGGPS9,其中CsGGPS9存在3條等位基因,分別是CsGGPS9-1、CsGGPS9-2和CsGGPS9-3,在系統(tǒng)進(jìn)化樹上與其他基因分成兩支。蛋白質(zhì)序列分析表明,茶樹GGPS家族成員都具有polyprenyl_synt結(jié)構(gòu)域,不存在信號肽序列。亞細(xì)胞定位預(yù)測結(jié)果顯示,CsGGPS1、CsGGPS2和CsGGPS4定位在葉綠體上,CsGGPS3和CsGGPS9定位在線粒體上。通過Swiss Model進(jìn)行三維建模,結(jié)合"three-floor"模型對茶樹GGPS家族成員的功能進(jìn)行預(yù)測,預(yù)測結(jié)果顯示,CsGGPS1、CsGGPS2和CsGGPS4是GGPS;CsGGPS3是異源二聚體形式的r{牛兒基焦磷酸合酶的小亞基;CsGGPS9的催化主產(chǎn)物是碳鏈數(shù)大于30的異戊烯基焦磷酸。q RT-PCR分析表明,CsGGPS1整體表達(dá)豐度較低,僅在一芽二葉中表達(dá)量稍高;CsGGPS2在茶樹各個組織中均有表達(dá),在花中表達(dá)量最高,且花發(fā)育過程中表達(dá)量先上升后下降;CsGGPS3在葉和幼根中的表達(dá)量高于花,花發(fā)育過程中表達(dá)平穩(wěn);CsGGPS4在茶樹各個組織中表達(dá)量數(shù)值相近,在花發(fā)育過程中表達(dá)量變化趨勢與CsGGPS2相同;CsGGPS9的表達(dá)量在成熟葉中顯著低于幼嫩葉片。
[Abstract]:Geranylgeranyl diphosphate synthases (diphosphate synthases) are structural enzymes of terpene synthesis pathway, and play an important role in plant growth and development. In this study, five potential GGPS sequences of tea tree were cloned by RACE and RT-PCR, named CsGGPS1-4 and CsGGPS9, respectively. There were three alleles in CsGGPS9, namely CsGGPS9-1, CsGGPS9-2 and CsGGPS9-3, which were separated from other genes in phylogenetic tree. Protein sequence analysis showed that the members of tea GGPS family all had polyprenyl_synt domain, and there was no signal peptide sequence. The results of subcellular localization prediction showed that CsGPS1, CsGGPS2 and CsGGPS4 were located in chloroplasts and CsGGPS3 and CsGGPS9 were located in mitochondria. The function of tea GGPS family members was predicted by Swiss Model and "three-floor" model. The expression of CsGGPS2 was higher only in one bud and two leaves, and the highest expression was in the flower, and the expression of CsGGPS3 in the leaves and young roots was higher than that in the young root, and the expression of CsGGPS3 in the flower development was higher than that in the flower, and the expression of CsGGPS3 in the leaves and young roots of tea plants was higher than that in the young roots. The expression of CsGGPS4 was similar in different tissues of tea plant during flower development, and the expression of CsGGPS9 in mature leaves was significantly lower than that in young leaves.
【作者單位】: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所國家茶樹改良中心農(nóng)業(yè)部茶樹生物學(xué)與資源利用重點實驗室;
【基金】:國家茶葉產(chǎn)業(yè)技術(shù)項目(CARS-023) 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程(CAAS-ASTIP-2014-TRICAAS)
【分類號】:S571.1

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本文編號:1791115

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