本文選題：陸地棉 + APX基因家族��； 參考：《棉花學(xué)報(bào)》2017年01期

【摘要】：【目的】抗壞血酸過(guò)氧化物酶(Ascorbate peroxidase,APX)是過(guò)氧化物酶家族中的1類成員,可以清除活性氧。APX家族的生物信息學(xué)分析有助于更好地了解該家族基因。【方法】利用生物信息學(xué)方法,從中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所提供的陸地棉序列中鑒定出14條APX基因家族序列,并對(duì)這14個(gè)成員的染色體定位、亞細(xì)胞定位、進(jìn)化關(guān)系、理化性質(zhì)、信號(hào)肽、保守基序以及其編碼蛋白的結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行了預(yù)測(cè)分析,并初步分析了部分基因的表達(dá)�！窘Y(jié)果】APX基因分布廣泛,分散在不同的染色體上;且大部分APX蛋白定位在細(xì)胞質(zhì),是親水性脂溶蛋白;有3個(gè)保守基序,保守性較強(qiáng);基因起源和進(jìn)化比較復(fù)雜;二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要元件為α-螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲。根據(jù)表達(dá)分析推測(cè),第1亞組和第2亞組的基因在棉纖維發(fā)育的不同時(shí)期起作用。【結(jié)論】這些結(jié)果有望為APX家族成員的結(jié)構(gòu)與功能挖掘提供參考。
[Abstract]:[objective] ascorbate peroxidase (APX) is a member of the peroxidase family, which can scavenge reactive oxygen species. The bioinformatics analysis of the APX family contributes to a better understanding of the family gene. [methods] the bioinformatics method is used. Fourteen APX gene family sequences were identified from cotton sequences provided by Cotton Institute of Chinese Academy of Agricultural Sciences, and the chromosomal localization, subcellular localization, evolutionary relationship, physicochemical properties, signal peptides of the 14 members were analyzed. The structural characteristics of conserved motifs and their encoded proteins were predicted, and the expression of some genes was preliminarily analyzed. [results] APX genes were widely distributed on different chromosomes, and most of APX proteins were located in cytoplasm. It has three conserved motifs, and the origin and evolution of genes are complex. The main components of secondary structure are 偽 -helix and irregular curl. According to the expression analysis, the genes of subgroup 1 and subgroup 2 play an important role in the development of cotton fiber. [conclusion] these results may provide references for the structure and function mining of members of APX family.
【作者單位】： 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院/教育部華北作物種質(zhì)資源研究與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/河北省作物種質(zhì)資源重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;河北農(nóng)業(yè)大學(xué)作物學(xué)博士后科研流動(dòng)站;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(31401426) 河北省自然科學(xué)基金(C2015204060) 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)作物學(xué)科梯隊(duì)建設(shè)基金(TD2016C319)
【分類號(hào)】：S562

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

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【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

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5 孫y泍，

本文編號(hào)：1790681