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霍山石斛PMM基因的克隆及其表達分析

發(fā)布時間:2018-04-22 08:33

  本文選題:霍山石斛 + PMM基因 ; 參考:《熱帶作物學報》2017年12期


【摘要】:為研究磷酸甘露糖變位酶基因(PMM)的功能及其在多糖生物合成中的表達調(diào)控機制,以霍山石斛原球莖為材料,利用RT-PCR技術(shù),克隆PMM基因,對其cDNA序列和表達情況進行分析。結(jié)果顯示:霍山石斛PMM基因cDNA序列長949 bp,包含一個747 bp的開放閱讀框,共編碼248個氨基酸,GenBank中的登錄號為KY912084。生物信息學分析表明:該蛋白屬于HAD超家族,可能是一種穩(wěn)定的、不具有信號肽和跨膜結(jié)構(gòu)的親水蛋白。系統(tǒng)進化樹分析表明,霍山石斛PMM與鐵皮石斛、海棗、油棕、蘆筍親緣關(guān)系較近,處于同一分支。qPCR結(jié)果顯示:PMM基因在莖中的相對表達量最高;在4種不同藥用石斛比較中,鼓槌石斛的相對表達量最高,霍山石斛的表達量最低。本研究結(jié)果表明PMM基因可能不僅參與到石斛多糖的合成,還與其它化合物的生物合成相關(guān)。
[Abstract]:In order to study the function of mannose phosphate mutase gene (PMM) and its regulation mechanism in polysaccharide biosynthesis, PMM gene was cloned from protocorm of Dendrobium huoshanense by RT-PCR technique, and its cDNA sequence and expression were analyzed. The results showed that the cDNA sequence of PMM gene of Dendrobium huoshanense was 949 BP long and contained a 747 BP open reading frame, which encode 248 amino acids in GenBank and the accession number was KY912084. Bioinformatics analysis showed that the protein belongs to HAD superfamily and may be a stable hydrophilic protein without signal peptide and transmembrane structure. Phylogenetic tree analysis showed that PMM of Dendrobium huoshanense was closely related to Dendrobium candidum, jujube, oil palm and asparagus. The relative expression of Dendrobium officinale was the highest, and that of Huoshan Dendrobium was the lowest. The results suggest that PMM gene may be involved not only in the synthesis of polysaccharides of Dendrobium, but also in the biosynthesis of other compounds.
【作者單位】: 福建省農(nóng)業(yè)科學院作物研究所;福建省農(nóng)業(yè)科學院花卉研究中心;福建省特色花卉工程技術(shù)研究中心;
【基金】:福建省省屬公益類科研院所專項(No.2015R1026-8) 福建省農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新項目(No.2015CX-1);福建省農(nóng)業(yè)科學院作物研究所青年開放基金項目(No.2015QN-4);福建省農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新團隊建設(No.2016PI-39)
【分類號】:S567.239

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