耐多藥結(jié)核分枝桿菌中耐利福平表型與基因型的研究
本文選題:耐多藥結(jié)核分枝桿菌 + 利福平。 參考:《遵義醫(yī)學(xué)院》2017年碩士論文
【摘要】:目的:了解耐多藥結(jié)核分枝桿菌中耐利福平表型與基因型的關(guān)系,以及結(jié)核分枝桿菌耐利福平機(jī)制。方法:對(duì)結(jié)核病患者臨床標(biāo)本進(jìn)行抗酸染色涂片、細(xì)菌培養(yǎng)、菌型鑒定及藥敏試驗(yàn),篩選耐多藥結(jié)核分枝桿菌并獲取其耐藥表型數(shù)據(jù)。提取菌株DNA,分別對(duì)耐利福平相關(guān)基因rpo B、rpo C、rpo A及rpo Z基因編碼區(qū)全長進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測序,獲得菌株耐藥基因型信息。測序結(jié)果在NCBI數(shù)據(jù)庫中與結(jié)核分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)菌株H37Rv序列進(jìn)行比對(duì),并分析結(jié)果。結(jié)果:本研究的71例耐多藥結(jié)核分枝桿菌菌株中,65例(91.5%)發(fā)生耐利福平相關(guān)的基因突變,包括rpo B、rpo C和rpo A多個(gè)基因的突變,無rpo Z基因突變,6例無上述4個(gè)基因突變。65例突變株均出現(xiàn)rpo B基因突變,其中63例(88.7%)發(fā)生在rpo B基因中利福平耐藥決定區(qū)(RRDR)內(nèi),以531(54.9%)、526(14.1%)及516(9.9%)位點(diǎn)突變?yōu)橹?2例單獨(dú)出現(xiàn)RRDR外基因突變;63例中有7例出現(xiàn)RRDR內(nèi)與RRDR外聯(lián)合突變。65例突變株中,27例(38.0%)發(fā)生rpo C基因突變,3例(4.2%)發(fā)生rpo A基因突變。rpo C及rpo A基因突變的菌株均同時(shí)在rpo B基因發(fā)生突變,即雙基因聯(lián)合突變。本研究共發(fā)現(xiàn)11種結(jié)核分枝桿菌耐利福平相關(guān)基因新型突變,包括7種rpo B基因突變:CCG126TCG、CTG511CCC、TCG574TAC、TCG663GCG、GGC747GAC和GTG250GCG/GTC251TAC聯(lián)合突變;4種rpo C基因突變:GAG49GCG、GGC332TGC、CCG434ACG及GCC710AC。結(jié)論:耐多藥結(jié)核分枝桿菌中耐利福平機(jī)制主要與rpo B基因(特別是RRDR內(nèi))突變有關(guān),而rpo B基因RRDR外部分區(qū)域、rpo C及rpo A基因可能作為rpo B基因補(bǔ)償基因。本研究發(fā)現(xiàn)11個(gè)耐利福平相關(guān)基因新型突變,為進(jìn)一步研究結(jié)核分枝桿菌耐利福平機(jī)制奠定實(shí)驗(yàn)室基礎(chǔ)。
[Abstract]:Aim: to investigate the relationship between rifampin resistance phenotype and genotype in multidrug resistant Mycobacterium tuberculosis and the mechanism of rifampicin resistance in Mycobacterium tuberculosis. Methods: acid fast staining smear, bacterial culture, bacterial type identification and drug sensitivity test were used to screen the multidrug resistant Mycobacterium tuberculosis and obtain the phenotypic data of drug resistance. The full-length coding region of rifampin-resistant gene rpo rpo C rpo A and rpo Z gene were amplified by PCR and sequenced respectively, and the genotype information of drug resistance was obtained. The sequencing results were compared with the H37Rv sequence of Mycobacterium tuberculosis standard strain in NCBI database and the results were analyzed. Results: in this study, 65 of 71 multidrug resistant Mycobacterium tuberculosis strains developed rifampin-resistant gene mutations, including mutations in rpo rpo C and rpo A genes. No mutation of rpo Z gene was found in 6 cases. All the 65 mutant strains had rpo B gene mutations, of which 63 cases (88. 7%) occurred in rifampicin resistance determining region (RRDR) of rpo B gene. 531% 54.9% and 516% 9. 9) mutation of rpo A gene in 2 out of 63 cases with RRDR gene mutation in 7 out of 63 cases, rpo C gene mutation occurred in 27 cases (38.0%) and rpo A gene mutation. RPO C gene mutation occurred in 3 cases (4. 2%). All the strains with rpo A gene mutation were mutated in rpo B gene at the same time. That is, the combination of two genes mutation. In this study, a total of 11 novel mutations in rifampicin-resistant genes of Mycobacterium tuberculosis were identified, including 7 mutations in the rpo B gene: TCG574TAC747GAC and GTG250GCG/GTC251TAC combined with TCG574TAC747GAC and GGC332TGCG434ACG and GCC710AC. Conclusion: the mechanism of rifampicin resistance in multidrug resistant Mycobacterium tuberculosis is mainly related to the mutation of rpo B gene (especially in RRDR), while the region of rpo B gene RRDR, rpo C and rpo A gene may be used as rpo B gene compensators. In this study, 11 novel rifampicin-resistant gene mutations were found, which laid a laboratory foundation for further study of rifampin resistance mechanism of Mycobacterium tuberculosis.
【學(xué)位授予單位】:遵義醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R52
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,本文編號(hào):1781179
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