本文選題：低能N+注入 + 沙漠寡營養(yǎng)細(xì)菌(DOB)��； 參考：《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》2017年01期

【摘要】：為了進(jìn)一步理解低能N+注入在沙漠寡營養(yǎng)細(xì)菌(DOB)系統(tǒng)發(fā)育與進(jìn)化中的作用,本研究基于DOB基因組De novo測序數(shù)據(jù),應(yīng)用生物信息學(xué)方法對3株離子束重組菌株DOB073、DOB113和DOB981的16S r RNA基因的突變與進(jìn)化進(jìn)行了分析。分析表明,3株離子束重組DOB的16S r RNA基因拷貝數(shù)均比原始菌株增加了5個,并分別在C1區(qū)、V1區(qū)、V2區(qū)、V4區(qū)、V6區(qū)、V7區(qū)和V9區(qū)發(fā)生了堿基突變。進(jìn)化分析顯示DOB981的進(jìn)化速度快于DOB073和DOB113。16S r RNA的保守二級結(jié)構(gòu)預(yù)測表明,9個保守二級結(jié)構(gòu)所處堿基位置分別為:80~120、120~240、240~360、360~480、400~520、640~760、760~880、800~920和1 420~1 540。本研究為低能離子注入介導(dǎo)的原核微生物進(jìn)化提供了直接的分子證據(jù)。
[Abstract]:In order to further understand the role of low energy N injection in the development and evolution of desert oligotrophic bacteria (DOB), this study was based on DOB genomic de novo sequencing data. The mutation and evolution of 16s r RNA gene of three ion beam recombination strains DOB073, DOB113 and DOB981 were analyzed by bioinformatics. The results showed that the copy number of 16s r RNA gene of the three ion beam recombinant DOB strains were increased by 5 compared with the original strain, and the base mutations occurred in the V6 region and V9 region in the V4 region of the V4 region and the V6 region in the C1 region. Evolutionary analysis showed that the evolution rate of DOB981 was faster than that of DOB073 and DOB113.16S r RNA. The results showed that the base positions of 9 conserved secondary structures were: 1: 80120120 / 240240240240240240240240240 / 460400 / 5206407606060880800 / 920 and 1 4201 54040 respectively. This study provides direct molecular evidence for the evolution of prokaryotic microorganisms mediated by low energy ion implantation.
【作者單位】： 新疆大學(xué)物理科學(xué)與技術(shù)學(xué)院離子束生物技術(shù)中心;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(11275164)資助
【分類號】：Q933

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本文編號：1777181