發(fā)布時(shí)間：2018-04-20 03:20

  本文選題：DQB基因 + PCR-SSCP��； 參考：《中國(guó)畜牧獸醫(yī)》2017年12期

【摘要】：試驗(yàn)旨在研究DQB2基因外顯子2多態(tài)性與哈薩克羊布魯氏菌病易感性的相關(guān)性。通過(guò)PCR-SSCP技術(shù)對(duì)146只布魯氏菌陰性哈薩克羊血液樣本和28只布魯氏菌陽(yáng)性哈薩克羊血液樣本中的白細(xì)胞表面抗原DQB2基因外顯子2的多態(tài)性進(jìn)行研究,挑取不同的等位基因進(jìn)行克隆測(cè)序,經(jīng)卡方檢驗(yàn)分析每個(gè)SNP位點(diǎn)的基因頻率、基因型頻率及其多態(tài)性與布魯氏菌病易感性的相關(guān)性,應(yīng)用生物信息學(xué)軟件分析與哈薩克羊布魯氏菌病易感性相關(guān)的不同等位基因的mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)及蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)和抗原表位。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在270bp的外顯子2序列中共檢測(cè)到33個(gè)SNPs,其中C9G、A180G位點(diǎn)的基因頻率在病例組和對(duì)照組中的分布具有極顯著性差異(P0.01),其基因型頻率在病例組和對(duì)照組中存在顯著差異(P0.05);A13T、C133G位點(diǎn)的基因頻率在病例組和對(duì)照組中存在顯著差異(P0.05);進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),A180G突變位點(diǎn)的最小自由能最低,其mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)最穩(wěn)定;A13T和C133G2個(gè)突變位點(diǎn)均引起mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)及蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)和抗原表位的改變。本試驗(yàn)結(jié)果表明DQB2基因外顯子2多態(tài)性與哈薩克羊布魯氏菌病易感性呈顯著相關(guān)。
[Abstract]:The aim of this study was to study the association between DQB2 gene exon 2 polymorphism and susceptibility to brucellosis in Kazak sheep. The polymorphisms of leukocyte surface antigen (DQB2) gene exon 2 in blood samples of 146 Brucella negative Kazakh sheep and 28 Brucella positive Kazakh sheep were studied by PCR-SSCP technique. Different alleles were selected for cloning and sequencing. The gene frequency, genotype frequency and polymorphism of each SNP locus were analyzed by chi-square test. Bioinformatics software was used to analyze the secondary structure of mRNA and the secondary structure of protein, tertiary structure and antigen epitope of different alleles associated with susceptibility to brucellosis in Kazak sheep. And it turns out, A total of 33 SNPs were detected in exon 2 of 270bp. There was a significant difference in the gene frequency of C9GnA180G locus between the case group and the control group (P0.01G). There was a significant difference in the genotype frequency between the case group and the control group (P0.05). There was significant difference in gene frequency between the two groups, and further analysis showed that the minimum free energy of A180G mutation was the lowest. The mutation sites of A13T and C133G2 in mRNA secondary structure caused the changes of secondary structure, protein secondary structure, tertiary structure and antigen epitope of mRNA. The results showed that the polymorphism of exon 2 of DQB2 gene was significantly associated with the susceptibility to brucellosis in Kazakh sheep.
【作者單位】： 石河子大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973計(jì)劃)(2010CB530200)
【分類號(hào)】：S826

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本文編號(hào)：1776013