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CREB1和BDNF基因交互作用與反復(fù)發(fā)作抑郁癥

發(fā)布時(shí)間:2018-04-19 20:42

  本文選題:反復(fù)發(fā)作抑郁癥 + 標(biāo)簽SNP; 參考:《鄭州大學(xué)》2017年碩士論文


【摘要】:目的探討CREB1基因與BDNF基因之間的交互作用與抑郁癥的關(guān)系。方法1.采用病例對(duì)照的研究設(shè)計(jì),對(duì)反復(fù)發(fā)作抑郁癥患者(抑郁組,n=768)及健康對(duì)照(對(duì)照組,n=511)的CREB1,BDNF基因標(biāo)簽SNP(tagSNPs)行SNPs質(zhì)譜分析檢測(cè)。2.使用廣義多因子降維法(GMDR)BetaV0.7軟件包行基因交互作用分析,得出最優(yōu)模型。使用Haploview4.2軟件行連鎖不平衡分析及單倍型分析,并對(duì)對(duì)照組中SNPs的基因型頻率分布進(jìn)行H-W檢驗(yàn)。SPSS17.0軟件整理分析數(shù)據(jù),對(duì)兩組間性別、SNPs的等位基因及基因型頻度的比較采用χ2檢驗(yàn),年齡行兩獨(dú)立樣本T檢驗(yàn);二元logistic回歸分析驗(yàn)證GMDR分析所得的最優(yōu)模型3.使用在線軟件系統(tǒng)(http://www.stat.ubc.ca/~rollin/stats/ssize/caco.html)進(jìn)行總樣本的統(tǒng)計(jì)效力測(cè)定。P0.05有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果1.抑郁組與對(duì)照組一般資料比較及5個(gè)SNPs的H-W檢驗(yàn)抑郁組和對(duì)照組性別、年齡比較,差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。對(duì)照組的H-W檢驗(yàn)顯示,CREB1rs3770704、rs2551645、rs4675690、BDNFrs7124442和rs10835210五個(gè)tagSNPs的基因型頻率的分布均符合HWE平衡(P0.05)。對(duì)照組中CREB1rs889895位點(diǎn)的突變等位基因C的頻率為0.2%,提示未發(fā)現(xiàn)CREB1rs889895位點(diǎn)的基因多態(tài)性,該位點(diǎn)未被納入統(tǒng)計(jì)分析中。在總樣本(n=1279,包括抑郁組與對(duì)照組兩組)中,統(tǒng)計(jì)效力為0.99。2.抑郁組和對(duì)照組5個(gè)SNPs等位基因及基因型頻度分布比較比較郁癥組與對(duì)照組5個(gè)SNPs的等位基因及基因型頻度發(fā)現(xiàn),CREB1rs4675690等5個(gè)SNPs位點(diǎn)的等位基因及基因型頻度分布在兩組間的差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P0.05。3.CREB1基因與BDNF基因的交互作用分析(1)一階模型與反復(fù)發(fā)作抑郁癥的關(guān)聯(lián)性:一階模型中rs10835210為最優(yōu)模型,該模型的樣本測(cè)試精確度為0.5319,交叉驗(yàn)證一致性為10/10,且對(duì)反復(fù)發(fā)作抑郁癥的患病風(fēng)險(xiǎn)有顯著地統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,1000次置換檢驗(yàn)的P值為0.0107。(2)二階及以上模型與反復(fù)發(fā)作抑郁癥的關(guān)聯(lián)性:未發(fā)現(xiàn)二階及以上模型中各SNP位點(diǎn)間的交互作用對(duì)反復(fù)發(fā)作抑郁癥患病風(fēng)險(xiǎn)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P0.05。4.rs10835210的一階模型中三種基因型與反復(fù)發(fā)作抑郁癥的相關(guān)性相對(duì)于攜帶野生型純合子CC個(gè)體,攜帶雜合子AC個(gè)體發(fā)生反復(fù)發(fā)作抑郁癥的OR值為0.772,95%CI為(0.608~0.980),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P=0.033,提示攜帶雜合子AC的個(gè)體較攜帶野生型純合子CC個(gè)體發(fā)生反復(fù)發(fā)作抑郁癥風(fēng)險(xiǎn)下降0.772倍。5.BDNF基因多態(tài)性及CREB1基因多態(tài)性連鎖不平衡分析和單倍型分析(1)BDNFrs7124442和rs10835210兩位點(diǎn)間不存在連鎖不平衡。CREB1rs3770704、rs2551645和rs4675690三個(gè)位點(diǎn)中,只有CREB1rs2551645和rs4675690兩位點(diǎn)之間存在連鎖不平衡,兩點(diǎn)間的D'值為0.904,r2值為0.664,滿足D'≥0.9,r20.5。(2)未發(fā)現(xiàn)由rs2551645和rs4675690兩位點(diǎn)的等位基因構(gòu)成的單倍型與反復(fù)發(fā)作抑郁組的相關(guān)性,P0.05。結(jié)論1.11號(hào)染色體上的BDNFrs10835210位點(diǎn)可能是反復(fù)發(fā)作抑郁癥的生物學(xué)標(biāo)記之一。2.CREB1rs2551645和rs4675690兩位點(diǎn)間存在連鎖不平衡,兩位點(diǎn)的等位基因可構(gòu)成單倍型,但未發(fā)現(xiàn)其與反復(fù)發(fā)作抑郁癥有關(guān)的證據(jù)。3.2號(hào)染色體上的CREB1rs889895位點(diǎn)突變等位基因C的頻率在中國(guó)漢族人群中為0.2%,該位點(diǎn)可能是微小突變基因位點(diǎn)。4.未發(fā)現(xiàn)CREB1rs3770704和BDNFrs7124442與反復(fù)發(fā)作抑郁癥有關(guān)的證據(jù)。
[Abstract]:Objective To investigate the relationship between the interaction of CREB1 gene and BDNF gene and the relationship between genotype frequency distribution of 5 SNPs in control group ( P 0.05 ) .

【學(xué)位授予單位】:鄭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R749.4

【參考文獻(xiàn)】

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2 張淵智;中國(guó)人HNPCC臨床表型及錯(cuò)配修復(fù)基因微小突變的快速篩檢平臺(tái)與患癌風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)作用[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2004年

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本文編號(hào):1774646

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