玉米光敏色素基因C的克隆與苗期光暗條件下表達(dá)分析
本文選題:玉米 + 光敏色素C ; 參考:《分子植物育種》2017年01期
【摘要】:光敏色素在植物的種子萌發(fā)、幼苗去黃化、葉片開張、莖伸長、開花等發(fā)育過程中具有重要調(diào)節(jié)作用。本研究根據(jù)玉米基因組數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)引物,獲得ZmPHYC1和ZmPHYC2基因序列,分析其編碼的氨基酸序列和結(jié)構(gòu)域發(fā)現(xiàn),6個(gè)不同光溫敏感性玉米品種中光敏色素C基因序列未出現(xiàn)大片段的序列插入或缺失,僅發(fā)現(xiàn)少量SNP;ZmPHYC1與ZmPHYC2蛋白中含有1個(gè)GAF結(jié)構(gòu)域、1個(gè)Phytochrome結(jié)構(gòu)域、2個(gè)PAS結(jié)構(gòu)域、1個(gè)His Kinase A結(jié)構(gòu)域和1個(gè)類似組氨酸激酶的ATP激酶結(jié)構(gòu)域;遺傳進(jìn)化樹分析表明,單子葉和雙子葉植物明顯聚為不同的類別,并且玉米和高粱之間的同源性要高于玉米中PHYC1與PHYC2之間的同源性。利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)分析ZmPHYC1和ZmPHYC2的表達(dá)模式發(fā)現(xiàn),在光暗處理?xiàng)l件下,兩個(gè)基因在不同品種間及各組織部位中表達(dá)量無顯著差異。
[Abstract]:Guang Min pigment plays an important role in the process of seed germination, seedling desalination, leaf opening, stem elongation, flowering and so on.In this study, ZmPHYC1 and ZmPHYC2 gene sequences were obtained by designing primers based on maize genome database.By analyzing the amino acid sequence and domain, we found that there was no insertion or deletion of large fragment of Guang Min pigment C gene in 6 maize varieties with different light and temperature sensitivity.Only a few SNPs ZmPHYC1 and ZmPHYC2 proteins contained one GAF domain, one Phytochrome domain, two PAS domains, one His Kinase A domain and one ATP kinase domain similar to histidine kinase.Monocotyledon and dicotyledonous plants were clustered into different classes, and the homology between maize and sorghum was higher than that between PHYC1 and PHYC2 in maize.The expression patterns of ZmPHYC1 and ZmPHYC2 were analyzed by real-time fluorescence quantitative PCR. It was found that there was no significant difference in the expression of ZmPHYC1 and ZmPHYC2 between different cultivars and tissues under the condition of light and dark treatment.
【作者單位】: 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué);遼寧省農(nóng)業(yè)科學(xué)院;
【基金】:遼寧省教育廳重點(diǎn)項(xiàng)目(LSNZD201608) 遼寧省自然基金(2014027027) 遼寧省科技廳農(nóng)業(yè)攻關(guān)及產(chǎn)業(yè)化項(xiàng)目(2015103001)共同資助
【分類號(hào)】:Q943.2;S513
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,本文編號(hào):1771783
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