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Affymetrix基因表達(dá)譜芯片技術(shù)篩選胰腺癌異常表達(dá)基因的研究

發(fā)布時(shí)間:2018-04-18 11:29

  本文選題:胰腺腫瘤 + 基因表達(dá)譜。 參考:《中國普通外科雜志》2017年03期


【摘要】:目的:利用基因表達(dá)譜芯片篩選出胰腺癌組織與癌旁正常組織的差異表達(dá)基因。方法:收集新疆醫(yī)科大學(xué)第三附屬醫(yī)院2014年1月—2016年6月間手術(shù)切除的10例胰腺導(dǎo)管細(xì)胞癌組織及其相應(yīng)癌旁正常組織,用TRIzol法提取總RNA后采用含49395個(gè)基因探針的Affymetrix基因表達(dá)譜芯片篩選出差異表達(dá)基因,并行GO分析和pathway分析,對(duì)部分差異表達(dá)基因行實(shí)時(shí)定量PCR法驗(yàn)證表達(dá)情況。結(jié)果:樣本總RNA檢測合格,基因芯片質(zhì)量評(píng)估良好,檢測結(jié)果可靠且可重復(fù)性高。經(jīng)芯片降噪處理后共檢測38079個(gè)基因,其中存在差異表達(dá)的基因共512個(gè),表達(dá)上調(diào)的基因419個(gè),表達(dá)下調(diào)的基因93個(gè);共287個(gè)差異表達(dá)基因編碼與3個(gè)GO分類(生物學(xué)過程、分子功能、細(xì)胞組分)相關(guān)的蛋白;共29條信號(hào)通路存在明顯基因差異表達(dá),涉及126個(gè)基因。經(jīng)PCR驗(yàn)證,差異表達(dá)基因CPB1、CELA3B、CPA1、POSTN、PLA2G1B、CTRC及SPINK1的表達(dá)情況與基因芯片檢測結(jié)果吻合。結(jié)論:胰腺導(dǎo)管細(xì)胞癌組織與癌旁正常組織間存在大量差異表達(dá)的基因,這些基因主要與生物學(xué)過程、分子功能及細(xì)胞組分相關(guān),且參與了多個(gè)細(xì)胞信號(hào)通路的調(diào)控。
[Abstract]:Objective : To investigate the expression of differentially expressed genes in pancreatic ductal carcinoma tissues and adjacent normal tissues by gene expression profiling . The results showed that there were a number of differentially expressed genes in pancreatic ductal carcinoma tissues from January 2014 to June 2016 .

【作者單位】: 新疆醫(yī)科大學(xué)第三附屬醫(yī)院肝膽外科;新疆醫(yī)科大學(xué)第五附屬醫(yī)院醫(yī)務(wù)部;廣東省深圳市羅湖區(qū)人民醫(yī)院普通外科;
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81360328)
【分類號(hào)】:R735.9

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):1768219

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