本文選題：絨山羊 + 光控增絨　； 參考：《中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年09期

【摘要】：為研究光控增絨和埋置褪黑激素促進(jìn)絨山羊在非產(chǎn)絨季節(jié)(5—8月份)長(zhǎng)絨的皮膚毛囊差異表達(dá)基因之間的互作關(guān)系,并篩選出皮膚毛囊發(fā)育相關(guān)的重要功能基因,以Agilent綿羊的全基因組表達(dá)譜芯片雜交獲得的光控增絨羊皮膚差異表達(dá)的99個(gè)基因及埋置褪黑激素絨山羊皮膚差異表達(dá)的83個(gè)基因作為研究對(duì)象,結(jié)合NCBI數(shù)據(jù)庫,利用RStudio程序包和Cytoscape 3.3.0構(gòu)建差異基因網(wǎng)絡(luò)并分析。光控增絨試驗(yàn)組差異基因構(gòu)建了1個(gè)主網(wǎng)絡(luò)和4個(gè)小網(wǎng)絡(luò);對(duì)照組差異基因構(gòu)建了1個(gè)主網(wǎng)絡(luò)和5個(gè)小網(wǎng)絡(luò)。與表達(dá)量結(jié)合分析基因網(wǎng)絡(luò)發(fā)現(xiàn),K25、KAP16-2基因上調(diào)促進(jìn)ISG17、RSRP1、GIMAP1和CYTIP基因的下調(diào),間接促進(jìn)TNFAIP6基因的下調(diào);CYP17A1、V15和K2-12(K85)基因的上調(diào)促進(jìn)ddit3基因的下調(diào);KAP16-3基因促進(jìn)CYP17A1基因的同時(shí)抑制CYP1A1基因。埋置褪黑激素試驗(yàn)組差異基因構(gòu)建了2個(gè)主網(wǎng)絡(luò)和7個(gè)小網(wǎng)絡(luò),對(duì)照組差異基因構(gòu)建了3個(gè)主網(wǎng)絡(luò)和1個(gè)小網(wǎng)絡(luò)。與表達(dá)量結(jié)合分析基因網(wǎng)絡(luò)發(fā)現(xiàn),CTNNB1基因的上調(diào)促進(jìn)COL3A1基因的下調(diào);FLT-1基因的上調(diào)促進(jìn)CGA基因的上調(diào)和COL1A2基因的下調(diào);PAX6基因的上調(diào)促進(jìn)DOK4基因的上調(diào)和LOC101110099基因的下調(diào);P450基因的上調(diào)促進(jìn)BLG基因的下調(diào)。光控增絨羊皮膚中篩選出來的基因中角蛋白、角蛋白關(guān)聯(lián)蛋白、CYP17A1、SP-D等23個(gè)顯著上調(diào)基因和CYP1A1、COL6A5、LOC100101238、ddit3等13個(gè)顯著下調(diào)基因?qū)饪卦鼋q羊皮膚毛囊提前進(jìn)入興盛期有重要作用;埋置褪黑激素的絨山羊皮膚中篩選出來的基因中CTNNB1、PAX6、DOK4、LOC105602529等13個(gè)顯著上調(diào)基因和酪蛋白家族、膠原蛋白類、LOC101110099等12個(gè)顯著下調(diào)基因之間的信號(hào)傳導(dǎo)增強(qiáng),從而促進(jìn)絨山羊絨毛進(jìn)入興盛期。
[Abstract]:In order to study the interaction between the differentially expressed genes in the skin follicles of cashmere goats during the non-cashmere season in May to August, the important functional genes related to the development of the hair follicles were screened out in order to study the interaction between the light-controlled cashmere enhancement and the embedding of melatonin.Ninety-nine differentially expressed genes in the skin of light-controlled cashmere sheep and 83 differentially expressed genes in the skin of buried melatonin goat were used as the research objects, and the NCBI database was used.RStudio package and Cytoscape 3.3.0 were used to construct and analyze the differential gene network.One main network and four small networks were constructed in the experiment group, and one main network and five small networks were constructed in the control group.The up-regulation of KAP16-2 gene promoted the down-regulation of ISG17RSRP1GIMAP1 and CYTIP gene, and indirectly promoted the down-regulation of TNFAIP6 gene (CYP17A1V15 and K2-12K85) gene. The up-regulation of KAP16-3 gene promoted the downregulation of ddit3 gene and inhibited CYP1A1 gene at the same time.Two main networks and seven small networks were constructed in melatonin test group, and 3 main networks and 1 small network were constructed in control group.Expression binding Analysis Gene Network found that the up-regulation of CTNNB1 gene promoted the down-regulation of COL3A1 gene and the up-regulation of FLT-1 gene promoted the up-regulation of CGA gene and the down-regulation of COL1A2 gene PAX6 gene promoted the up-regulation of DOK4 gene and the down-regulation of LOC101110099 gene.The up-regulation of P450 gene promotes the down-regulation of BLG gene.There were 23 up-regulated genes such as keratin, CYP17A1SP-D and 13 down-regulated genes such as CYP17A1SP-D and 13 down-regulated genes such as CYP1A1, COL6A5, LOC100101238, DDIT3, etc., which played an important role in the early development of hair follicles of light-controlled cashmere sheep.13 genes, such as CTNNB1, PAX6, DOK4, LOC105602529 and so on, significantly up-regulated the signal transduction among 12 down-regulated genes, such as collagen, LOC101110099 and so on, among the genes screened out from the skin of cashmere goats embedded with melatonin, such as CTNNB1, PAX6, DOK4, LOC105602529 and so on.Thus promoting cashmere goat villus into the prosperous period.
【作者單位】： 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;內(nèi)蒙古農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院畜牧研究所;中國科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所;鄂托克前旗獸醫(yī)局;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31260545);國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31402052) 國家公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(201303059) 內(nèi)蒙古自治區(qū)自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(2014BS0333) 內(nèi)蒙古自治區(qū)創(chuàng)新基金項(xiàng)目(2013CXJJM03) 內(nèi)蒙古自治區(qū)科技創(chuàng)新引導(dǎo)項(xiàng)目 內(nèi)蒙古自然科學(xué)基金博士項(xiàng)目(2014BS0313) 內(nèi)蒙古民族大學(xué)科學(xué)研究項(xiàng)目(BS308)
【分類號(hào)】：S827

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本文編號(hào)：1767946