番茄qRT-PCR內(nèi)參基因的篩選
本文選題:番茄 + 實時熒光定量PCR; 參考:《江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報》2017年02期
【摘要】:以高溫、低溫、鹽脅迫、TYLCV接種處理和對照的番茄幼苗為植物材料,通過實時熒光定量RT-PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)方法分析了常用的8個內(nèi)參基因肌動蛋白基因(ACT)、甘油醛-3-磷酸脫氫酶基因(GAPDH)、泛素基因(UBI)、18S核糖體RNA基因(18S)、轉(zhuǎn)錄延伸因子基因(EF-1a)、β-微管蛋白基因(TUB)、表達蛋白基因(EXP)和接合素蛋白復(fù)合物基因(CAC)在不同樣本中的表達情況。利用ge Norm和Norm Finder軟件分析篩選表達穩(wěn)定性較高的內(nèi)參基因。結(jié)果表明,在不同脅迫處理條件下,UBI和ACT的穩(wěn)定性較高;在同樣的脅迫處理中,8個內(nèi)參基因的表達穩(wěn)定性不同。綜合而言,雖然UBI和ACT的穩(wěn)定性同樣較高,但在TYLCV接種處理試驗中ACT的穩(wěn)定性相對較差,而TUB和GAPDH表達較穩(wěn)定,故TUB和GAPDH可在TYLCV接種處理試驗中作為番茄qRT-PCR的內(nèi)參基因。
[Abstract]:Tomato seedlings inoculated with TYLCV at high temperature, low temperature and salt stress were used as plant materials.By using real-time RT-PCR(Real-time fluorescence quantitative PCRQRT-PCRR, eight common domestic reference gene actin genes, Actr, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, UBIN 18s ribosomal RNA gene, transcription extension factor gene EF-1a, 尾 -tubulin protein were analyzed by using real-time fluorescence quantitation method. The results were as follows: GAPDHN, UBIN 18s ribosomal RNA gene, transcriptional extension factor gene EF-1aa1, 尾 -tubulin protein, 尾 -tubulin.The expression of TUBN, express protein gene (exp) and conjugate protein complex gene (CAC) in different samples.GE Norm and Norm Finder software were used to analyze and screen stable internal reference genes.The results showed that the stability of UBI and ACT was higher under different stress conditions, and the stability of expression of 8 internal reference genes was different in the same stress treatment.In general, although the stability of UBI and ACT was also high, the stability of ACT was relatively poor in TYLCV inoculation test, while the expression of TUB and GAPDH was stable. Therefore, TUB and GAPDH could be used as internal reference genes of qRT-PCR in TYLCV inoculation test.
【作者單位】: 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院;江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所;
【基金】:國家自然科學(xué)青年基金項目(31401884) 江蘇省自然科學(xué)青年基金項目(BK20140739) 江蘇省自主創(chuàng)新基金項目[CX(14)5012] 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院基本科研業(yè)務(wù)專項[ZX(15)2003]
【分類號】:S641.2
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,本文編號:1766705
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