基于RNA-seq分析褪黑素對內(nèi)蒙古絨山羊毛囊發(fā)育相關(guān)基因表達(dá)的影響
本文選題:絨山羊 + 褪黑激素 ; 參考:《內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:本研究基于課題組前期獲得的內(nèi)蒙古絨山羊皮膚組織的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),通過GO信息注釋、KEGG信號通路分析,得到內(nèi)蒙古絨山羊皮膚組織試驗(yàn)組與對照組2月、10月、12月的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。選取Wnt10b、β-catenin、SFRP1、FGF21、TCHHL1等5個差異基因作為候選基因,通過熒光定量PCR技術(shù)和Western-blot技術(shù),分析這5個基因在mRNA水平和2個蛋白水平上的表達(dá),為深入探索褪黑激素促進(jìn)絨毛生長機(jī)理提供理論依據(jù),主要研究結(jié)果如下:(1)應(yīng)用生物信息學(xué)技術(shù)對內(nèi)蒙古成年絨山羊試驗(yàn)組與對照組2月、10月、12月皮膚組織轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行差異基因的篩選。3個月份共篩選出1478個差異基因,其中上調(diào)的1014個,下調(diào)的464個。(2)熒光定量PCR結(jié)果顯示:埋植褪黑激素,使Wnt10b基因在1月、3月表達(dá)量顯著的高于對照組(P0.05),在2月的表達(dá)量顯著低于對照組(P0.05);β-catenin基因在11月、1月表達(dá)量顯著高于對照組(P0.05),在7月表達(dá)量顯著低于對照組(P0.05);FG21基因在,11月、1月、2月表達(dá)量顯著高于對照組(P0.05);SFRP1基因在6月、7月表達(dá)量顯著高于對照組(P0.05),在其他月份均無顯著差異(P0.05)TCHHL1基因在4月、6月、8月表達(dá)量顯著低于對照組(P0.05),1月、2月的表達(dá)量顯著高于對照組(P0.05)。(3)Western blot結(jié)果顯示:Wnt1Ob蛋白的表達(dá)量在12月、2月試驗(yàn)組顯著高于對照組(P0.05);而在9月差異不顯著(P0.05)。β-catenin蛋白表達(dá)量在9月試驗(yàn)組顯著低于對照組(P0.05),而在12月、2月試驗(yàn)組與對照組β-catenin蛋白表達(dá)量差異不顯著(P0.05)。由以上研究結(jié)果可知,Wnt10b、β-catenin、SFRP1、FGF21、TCHHL1等5個差異基因在褪黑激素促進(jìn)絨毛生長發(fā)育中起到重要作用。
[Abstract]:Based on the transcriptional data of Inner Mongolia Cashmere Goats (Cashmere Goats), we obtained the transcriptional data of Inner Mongolia Cashmere Goat skin tissue test group and control group in February, October and December through go information annotation and KEGG signal pathway analysis.Five differentially expressed genes, Wnt10b, 尾 -cateninine SFRP1FGF21, TCHHL1, were selected as candidate genes. The expression of these five genes at mRNA level and 2 protein levels were analyzed by fluorescence quantitative PCR and Western-blot techniques.It provides a theoretical basis for further exploring the mechanism of melatonin promoting the growth of villi.The main results are as follows: (1) using bioinformatics to screen differentially expressed genes between the experimental group of Inner Mongolia adult cashmere goat and the control group in February, October and December. A total of 1478 differentially expressed genes were screened in three months.Of these, 1014 were up-regulated and 464 were down-regulated. PCR results showed that melatonin was implanted.The expression of Wnt10b gene was significantly higher in January and March than that in control group, and was significantly lower in February than that in control group, while the expression of 尾 -catenin gene in November and January was significantly higher than that in control group, and in July it was significantly lower than that in control group.In November, January and February, the expression level of SFRP1 gene was significantly higher than that of control group in June, and the expression level in July was significantly higher than that in control group. There was no significant difference in other months. The expression of TCHHL1 gene in April, June and August was significantly lower than that in control group, 2 January.The results of Western blot showed that the expression of Wnt1Ob protein in the control group was significantly higher in December than that in the control group in 2 months, but not in September. The expression of 尾 -catenin protein in the control group was significantly lower than that in the control group in September, and the expression of 尾 -catenin protein in the control group was significantly lower than that in the control group in September, and the expression of 尾 -catenin protein in the control group was significantly lower than that in the control group in September.However, there was no significant difference in the expression of 尾 -catenin between the experimental group and the control group in 12 months and 2 months.According to the above results, five differentially expressed genes, Wnt10b, 尾 -cateninine SFRP1FGF21 and TCHHL1, play an important role in the growth and development of villi by melatonin.
【學(xué)位授予單位】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S827
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號:1765284
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