橡膠樹生殖發(fā)育相關基因的RNA-Seq轉錄組分析
本文選題:橡膠樹 + 生殖發(fā)育; 參考:《分子植物育種》2017年01期
【摘要】:為了揭示橡膠樹生殖發(fā)育相關基因的表達變化情況,本研究以橡膠樹熱研7-33-97花序、雄蕊、雌蕊為試驗材料,利用Illumina HiSeq~(TM) 2000對早期發(fā)育的花序、雄蕊及雌蕊進行RNA-Seq測序,共識別出30 164個長度大于200 bp的Unigenes,與其它物種的序列相似性進行比較,發(fā)現(xiàn)所得Unigenes與麻瘋樹的Unigenes相似數(shù)量最多。進一步對測序所得Unigenes進行GO(Gene ontology)功能注釋和Pathway顯著性富集分析發(fā)現(xiàn)這些Unigenes能夠編碼相應的993種酶(Enzyme,EC),參與了197條生物學通路(pathway),相關Unigenes主要涉及碳水化合物運輸與代謝、膜轉運代謝以及能量代謝通路,由此推測碳水化合物合成與運輸相關基因可能在橡膠樹生殖發(fā)育過程中起重要調控作用。本研究通過對橡膠樹花器官發(fā)育相關基因進行轉錄水平分析,為深入開展橡膠樹生殖發(fā)育相關功能基因的克隆和功能驗證提供了豐富的基因資源,并為揭示橡膠樹生殖發(fā)育的分子調控機制奠定良好基礎。
[Abstract]:In order to reveal the expression of genes related to reproductive development of rubber tree, the rubber tree SCATC 7-33-97 inflorescence, stamen, pistil as experimental materials, the use of Illumina HiSeq~ (TM) 2000 on the early development of the inflorescence, stamen and pistil of RNA-Seq sequencing, consensus don't 30164 length more than 200 bp Unigenes, and sequence other species similarity comparison, found with Unigenes from Jatropha curcas is similar to the Unigenes number of Unigenes. Further sequencing of GO (Gene ontology) functional annotation and Pathway significant enrichment analysis showed that these Unigenes encoding 993 enzymes (Enzyme, EC) corresponding, involved in 197 biological pathways (pathway) Unigenes, mainly involved in carbohydrate transport and metabolism, membrane transport and metabolism and energy metabolism pathway, which indicated that the carbohydrate synthesis and transport related genes may be. To play an important role in the reproductive development of rubber trees. Through the research of rubber tree related to floral organ development in the gene transcription level analysis, to carry out the rubber tree reproductive cloning and functional verification of related genes provides abundant gene resources, and lay a good foundation for revealing the molecular regulation mechanism of rubber tree reproductive development.
【作者單位】: 中國熱帶農業(yè)科學院橡膠研究所;海南大學農學院;
【基金】:國家天然橡膠產業(yè)技術體系項目(CARS-34) 中國熱帶農業(yè)科學院橡膠研究所基本科研業(yè)務費(163002201-6016)共同資助
【分類號】:S794.1;Q943.2
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,本文編號:1764060
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