本文選題：豬流行性腹瀉病毒 + ORF基因　； 參考：《中國獸醫(yī)學(xué)報》2017年08期

【摘要】：為了解豬流行性腹瀉病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)河南株的起源和遺傳變異,本試驗對2014年8月—2015年5月,來自河南省16個規(guī)模豬場仔豬表現(xiàn)為嚴(yán)重腹瀉、食欲下降和脫水等臨床特征的22份病料樣品,利用RT-PCR方法,擴(kuò)增PEDVORF3基因,回收PCR產(chǎn)物克隆至pMD18-T載體,并進(jìn)行測序分析。結(jié)果顯示,22份病料樣品均能擴(kuò)增出PEDVORF3基因,其序列長度均為849bp,包含一個完整閱讀框(675bp),編碼224個氨基酸殘基。22個河南株之間核苷酸同源性為95.9%~100%,與歐洲經(jīng)典毒株CV777同源性介于97.1%~97.9%,存在8個位點發(fā)生相同的氨基酸置換,與Truncated CV777株同源性介于94.8%~95.4%。基因遺傳進(jìn)化樹分析表明,PEDV毒株可分為2大群,河南株屬于第Ⅱ群,整體獨立成支,與河南往年流行株、國內(nèi)分離株、日本、美國及韓國毒株親緣關(guān)系較近,而與CV777株、Truncated CV777株親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。結(jié)果表明PEDV河南株ORF3基因存在變異,為PEDVORF3基因的蛋白功能研究和河南省PED的防控提供技術(shù)支持。
[Abstract]:In order to understand the origin and genetic variation of porcine epidemic diarrhea virus (PEV) Henan strain, this experiment showed severe diarrhea in piglets from 16 pig farms in Henan province from August 2014 to May 2015.RT-PCR method was used to amplify the PEDVORF3 gene from 22 samples with clinical characteristics such as loss of appetite and dehydration. The PCR product was recovered and cloned into pMD18-T vector and sequenced.The results showed that PEDVORF3 gene could be amplified from 22 samples.The sequence length was 849 BP, containing a complete reading frame of 675 BP, encoding 224 amino acid residues. The nucleotide homology of 22 Henan strains was 95.9%, and the homology with European classical virus strain CV777 was between 97.1 and 97.9. There were 8 amino acid substitutions at the same sites.The homology with Truncated CV777 strain was 94.8%.Genetic phylogenetic tree analysis showed that the PEDV strains could be divided into two groups. Henan strain belonged to the second group, which was independent and related to the previous epidemic strains in Henan Province, the domestic isolates, Japan, the United States and Korea.The relationship between Truncated CV777 strain and CV777 strain was far from that of Truncated CV777 strain.The results showed that the variation of ORF3 gene in Henan strain of PEDV provided technical support for the study of protein function of PEDVORF3 gene and the prevention and control of PED in Henan province.
【作者單位】： 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)牧醫(yī)工程學(xué)院;吉林大學(xué)動物醫(yī)學(xué)學(xué)院;河南牧業(yè)經(jīng)濟(jì)學(xué)院;鄭州市豬重大疫病防控重點實驗室;
【基金】：河南省產(chǎn)學(xué)研合作資助項目(132107000002,152107000003)
【分類號】：S852.651

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本文編號：1761903