小鼠GATA-3基因RNA干擾慢病毒載體的構(gòu)建與鑒別
本文選題:鼻炎 + 變應(yīng)性 ; 參考:《臨床耳鼻咽喉頭頸外科雜志》2017年08期
【摘要】:目的:探索干擾小鼠GATA-3基因的慢病毒載體的構(gòu)建與鑒別方法。方法:分析小鼠單個核細胞內(nèi)GATA-3基因的編碼區(qū),設(shè)計并合成3條最佳動力學(xué)參數(shù)靶點干擾序列的單鏈oligo。利用PCR技術(shù)對合成的單鏈oligo進行拼接反應(yīng),將合成好的序列裝入shRNA慢病毒載體并轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細胞DH5α,測序并鑒定重組克隆中的基因序列后構(gòu)建shRNA-GATA-3表達載體。根據(jù)不同的干擾序列將慢病毒載體分為4組:siRNA-685(LV3-GATA-3-Mus-685)組、siRNA-1152(LV3-GATA-3-Mus-1152)組、siRNA-1615(LV3-GATA-3-Mus-1615)組和對照組。將shRNA載體分別與表達載體共轉(zhuǎn)染入293T細胞,通過qPCR檢測篩選出最優(yōu)干擾序列。將篩選到最佳的LV3-GATA-3-Mus-1615干擾序列構(gòu)建入慢病毒載體,用構(gòu)建的慢病毒干擾載體和包裝質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293T細胞,包裝病毒,收集病毒原液,超速離心濃縮,并測定滴度。結(jié)果:克隆測序驗證無誤,慢病毒載體構(gòu)建成功。siRNA-1615組GATA-3mRNA相對表達量(0.004)與siRNA-685組(0.009)、siRNA-1152組(0.009)和對照組(0.022)相比明顯減少,LV3-GATA-3-Mus-1615為最佳的干擾序列。收集的病毒上清測定病毒的滴度為5×10~8 TU/ml。轉(zhuǎn)染實驗48h后,熒光顯微鏡觀察轉(zhuǎn)染成功。結(jié)論:成功構(gòu)建并鑒定小鼠GATA-3基因RNAi慢病毒載體。
[Abstract]:Objective: to explore the construction and identification of lentivirus vector which interferes with mouse GATA-3 gene.Methods: the coding region of GATA-3 gene in mouse mononuclear cells was analyzed and three target interference sequences with optimal kinetic parameters were designed and synthesized.The synthesized single-stranded oligo was spliced by PCR technique. The synthesized sequence was inserted into the shRNA lentivirus vector and transformed into the competent cell DH5 偽. After sequencing and identifying the gene sequence in the recombinant clone, the shRNA-GATA-3 expression vector was constructed.According to different interference sequences, lentivirus vectors were divided into 4 groups: 1: siRNA-685 (LV3-GATA-3-Mus-685)) group (LV3-GATA-3-Mus-1152)) and control group.The shRNA vector and the expression vector were cotransfected into 293T cells, and the optimal interference sequence was screened by qPCR detection.The best LV3-GATA-3-Mus-1615 interference sequence was constructed into lentivirus vector. The vector was co-transfected into 293T cells. The virus was packaged, the virus solution was collected, the concentration was determined by ultracentrifugation, and the titer was measured.Results: cloning and sequencing proved that lentivirus vector constructed successfully. SiRNA-1615 group GATA-3mRNA relative expression was 0.004) compared with siRNA-685 group 0.009 siRNA-1152 group (0.009) and control group (0.022) significantly reduced LV3-GA-3-Mus-1615 interference sequence.The titer of the collected virus supernatant was 5 脳 10 ~ (8) TU / ml.After 48 hours of transfection, the transfection was observed successfully by fluorescence microscope.Conclusion: the murine GATA-3 gene RNAi lentivirus vector was successfully constructed and identified.
【作者單位】: 昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科;中國科學(xué)院昆明動物研究所動物模型與人類疾病機理重點實驗室;
【基金】:云南省自然基金資助項目(No:2011FZ120)
【分類號】:R765.21
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