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丹參中轉(zhuǎn)錄因子SmMYB87基因的克

發(fā)布時間:2018-04-14 13:25

  本文選題:丹參 + RR。 參考:《中草藥》2017年17期


【摘要】:目的克隆丹參Salvia miltiorrhiza中第14亞群R2R3 MYB轉(zhuǎn)錄因子基因SmMYB87的全長序列,并對其進行生物信息學(xué)和表達分析。方法以丹參總RNA為模板,利用同源克隆和c DNA快速擴增(RACE)技術(shù)獲得SmMYB87 cDNA全長序列。運用生物信息學(xué)軟件對該基因及其編碼蛋白進行結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)分析,利用q RT-PCR測定SmMYB87在各器官中的表達并構(gòu)建融合表達載體pTF-486-SmMYB87分析SmMYB87蛋白的亞細胞定位。結(jié)果 SmMYB87基因含有2個內(nèi)含子和1個732 bp的開放閱讀框(ORF),編碼243個氨基酸。該基因在根、莖、葉和花中均有表達,且4個器官中的表達量沒有顯著差異。SmMYB87蛋白在細胞核和細胞膜上均有分布。結(jié)論 SmMYB87的序列結(jié)構(gòu)和表達分析為進一步研究其在丹參中的生物學(xué)作用奠定了理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective to clone the full-length SmMYB87 gene of R2R3 MYB transcription factor gene from Salvia miltiorrhiza (Salvia) miltiorrhiza and analyze its expression and bioinformatics.Methods using total RNA of Salvia miltiorrhiza as template, the full-length sequence of SmMYB87 cDNA was obtained by homologous cloning and rapid amplification of C DNA.The structure and physicochemical properties of the gene and its encoded protein were analyzed by bioinformatics software. The expression of SmMYB87 in various organs was determined by Q RT-PCR and the fusion expression vector pTF-486-SmMYB87 was constructed to analyze the subcellular localization of SmMYB87 protein.Results the SmMYB87 gene contained 2 introns and 1 732 BP open reading frame, encoding 243 amino acids.The gene was expressed in root, stem, leaf and flower, and there was no significant difference in the expression of SmMYB87 protein in the nucleus and cell membrane.Conclusion the sequence structure and expression analysis of SmMYB87 lay a theoretical foundation for further study of its biological role in Salvia miltiorrhiza.
【作者單位】: 揚州大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;揚州大學(xué)園藝與植物保護學(xué)院;浙江理工大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項目(31700257,81373908) 江蘇省高校自然科學(xué)研究面上項目(16KJB180032) 中國博士后科學(xué)基金面上項目(2015M571826)
【分類號】:S567.53

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本文編號:1749516

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