本文選題：大黃魚 + microRNA�。� 參考：《核農(nóng)學(xué)報(bào)》2017年07期

【摘要】：為篩選適用于大黃魚miRNA研究的內(nèi)參基因,選取饑餓試驗(yàn)組(EG)中饑餓21d及正常投喂組(CG,對照)的大黃魚肌肉組織進(jìn)行miRNA高通量測序,初步篩選得到穩(wěn)定表達(dá)的6個(gè)miRNA:miR-23a-3p,miR-4508,miR-1961,miR-1297,miR-1956-3p和Let-7。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測這6個(gè)miRNA和3個(gè)傳統(tǒng)的內(nèi)參基因(U6,5S和18S)在大黃魚6種組織(肌肉、肝臟、腎、脾、腦和心臟)以及不同饑餓時(shí)間段的肌肉組織中的表達(dá),并利用Ge Norm,Best Keeper以及Norm Finder對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。結(jié)果表明,miRNA的表達(dá)穩(wěn)定性優(yōu)于傳統(tǒng)內(nèi)參基因。在CG組大黃魚不同組織中,最穩(wěn)定單內(nèi)參基因是miR-23a-3p,最佳內(nèi)參基因組合為miR-23a-3p和Let-7。在不同饑餓時(shí)間的EG組大黃魚肌肉組織中,最穩(wěn)定單內(nèi)參基因是miR-23a-3p,最佳內(nèi)參基因組合為Let-7和miR-1961。本試驗(yàn)結(jié)果為研究大黃魚miRNA時(shí)內(nèi)參基因的選擇提供了參考。
[Abstract]:In order to screen the internal reference gene suitable for the miRNA study of large yellow croaker, the muscle tissues of large yellow croaker, which were starved for 21 days and fed on normal diet group, were selected for high-throughput miRNA sequencing. Six miRNAs, miRNA-miR-23a-3pmcmiR-4508miR-1961miR-1297miR-1956-3p and Let-7miR-1956-3p were obtained.The expression of these six miRNA and three traditional internal reference genes (U6N5S and 18s) in six tissues (muscle, liver, kidney, spleen, brain and heart) of large yellow croaker and the muscle tissues of different starvation periods were detected by real-time fluorescence quantitative PCR.The data are analyzed by GE Norm Best Keeper and Norm Finder.The results showed that the expression stability of miRNA was superior to that of traditional reference gene.The most stable single reference gene was miR-23a-3pin different tissues of large yellow croaker in CG group. The best combination of internal reference gene was miR-23a-3p and Let-7.The most stable single reference gene was miR-23a-3p in muscle tissue of large yellow croaker with different starvation time. The best combination of internal reference gene was Let-7 and miR-1961.The results of this study provided a reference for the selection of internal reference gene in miRNA of Pseudosciaena Crocea.
【作者單位】： 寧波大學(xué)海洋學(xué)院;寧波大學(xué)浙江海洋高效健康養(yǎng)殖協(xié)同創(chuàng)新中心;
【基金】：浙江省自然科學(xué)基金(LY15C190005) 浙江省科技廳項(xiàng)目(2016C02055-7) 寧波市科技局項(xiàng)目(2015C110005)
【分類號】：Q78;S917.4

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 王玫;李思光;羅玉萍;;microRNA識別和鑒定方法[J];細(xì)胞生物學(xué)雜志;2007年04期

2 王晶;朱榮勝;宋萬坤;張聞博;劉春燕;胡國華;陳慶山;;microRNA的實(shí)驗(yàn)和生物信息學(xué)開發(fā)方法[J];生物技術(shù)通報(bào);2008年S1期

3 田明;費(fèi)菁;胡曉湘;李寧;劉娣;孟慶勇;;microRNA-1,-133,-206在鼠肌肉中的表達(dá)譜[J];中國畜牧獸醫(yī);2009年08期

4 王芳;余佳;張俊武;;小RNA(MicroRNA)研究方法[J];中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào);2006年10期

5 鄭玉姝;趙樸;趙宏坤;;microRNA及其應(yīng)用前景[J];生物技術(shù)通訊;2007年01期

6 王春梅;李慶章;;microRNA在小鼠乳腺不同發(fā)育時(shí)期差異表達(dá)譜及作用(英文)[J];遺傳學(xué)報(bào);2007年11期

7 鄒文輝;;新奇的調(diào)控分子——microRNA[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2008年34期

8 ;MIRE: A GRAPHICAL R PACKAGE FOR MICRORNARELATED ANALYSIS[J];Chinese Medical Sciences Journal;2008年04期

9 張坤山;李思光;羅玉萍;;調(diào)控過氧化物酶體生物合成和增殖的microRNA的計(jì)算機(jī)分析[J];細(xì)胞生物學(xué)雜志;2009年02期

10 閆曉紅;王寧;;轉(zhuǎn)錄因子與microRNA在基因表達(dá)調(diào)控中的功能聯(lián)系及差異[J];中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào);2010年10期

相關(guān)會議論文 前10條

1 靳新;駱志剛;王金華;管乃洋;;microRNA靶標(biāo)研究進(jìn)展[A];中國遺傳學(xué)會功能基因組學(xué)研討會論文集[C];2006年

2 Shanshan liu;Hanjiang Fu;Yinghua Jing;Xiaofei Zheng;;Using PAR -CLIP to discover novel functions for DGCR8 complex[A];泛環(huán)渤海地區(qū)九省市生物化學(xué)與分子生物學(xué)會——2011年學(xué)術(shù)交流會論文集[C];2011年

3 Jian-Qing PAN;Cheng ZHONG;Xue-Mei LIU;Xiao-Lei LIU;Li-Ping WANG;;Expression of Channelrhodopsin-2(ChR2) in serotonergic neurons using microRNA-regulated vector designs[A];中國神經(jīng)科學(xué)學(xué)會第十屆全國學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2013年

4 Pengping Li;Jie Lee;Jin Wang;;Topological properties of house-keeping and tissue-specific microRNA in regulatory network for different tissues[A];第五屆全國生物信息學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)學(xué)術(shù)大會論文集[C];2012年

5 ;Prediction of human microRNA precursors using graph properties and random forest[A];第十屆全國計(jì)算(機(jī))化學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2009年

6 李思閱;秦莉;美朗曲措;周易;宋興勃;周娟;應(yīng)斌武;;microRNA形成通路中單核苷酸多態(tài)性與中國藏族人群結(jié)核相關(guān)性研究[A];中華醫(yī)學(xué)會第九次全國檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會議暨中國醫(yī)院協(xié)會臨床檢驗(yàn)管理專業(yè)委員會第六屆全國臨床檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室管理學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2011年

7 廖玉輝;周小明;邢達(dá);;基于非酶擴(kuò)增及電化學(xué)發(fā)光原理的microRNA檢測方法[A];廣東省生物物理學(xué)會2013年學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2013年

8 王春梅;李慶章;;microRNA在乳腺發(fā)育及泌乳中的作用[A];東北三省生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)會2008年學(xué)術(shù)交流會論文摘要[C];2008年

9 Su Bee Tan;Jinbo Li;Xi Chen;Yan Zhang;Chen-yu Zhang;;Small molecule inhibitor of muscle specific microRNA[A];第八屆全國化學(xué)生物學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2013年

10 Chao Zeng;Man Li;Yang Xi;Wennan Zhu;Xiang Lv;Depei Liu;;microRNA-122 affects cell cycle potentially through cyclins[A];中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)會第十屆會員代表大會暨全國學(xué)術(shù)會議摘要集[C];2010年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 呂洋;正常受精、克隆與轉(zhuǎn)基因牛的成纖維細(xì)胞microRNA表達(dá)譜分析[D];內(nèi)蒙古大學(xué);2016年

2 陳艷霞;馬鹿（Cervus elaphus）鹿茸快速生長期生長點(diǎn)軟骨和茸皮組織microRNA表達(dá)譜研究[D];東北林業(yè)大學(xué);2016年

3 陳葉;豬圓環(huán)病毒2型遺傳進(jìn)化及影響PK15細(xì)胞microRNA差異表達(dá)的研究[D];華南農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

4 李娜;細(xì)胞microRNA以及病毒小分子RNA抑制豬繁殖與呼吸綜合征病毒感染豬肺泡巨噬細(xì)胞的作用機(jī)制[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年

5 魯玉柱;水稻microRNA和其它相關(guān)小分子RNA的克隆鑒定[D];武漢大學(xué);2005年

6 郝瑞;不同干擾作用下microRNA在胚胎發(fā)育過程中的表達(dá)分析和功能研究[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

7 阮靈偉;深海熱液區(qū)管狀蠕蟲的分子特征及對蝦microRNA的初探[D];廈門大學(xué);2009年

8 徐鳳丹;microRNA基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動力學(xué)與功能研究[D];上海大學(xué);2010年

9 顏興起;MicroRNA功能的生物信息學(xué)分析及相關(guān)平臺的建立[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2008年

10 汪小我;microRNA相關(guān)問題的計(jì)算分析[D];清華大學(xué);2008年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 王娜娜;microRNA進(jìn)化關(guān)系及編碼特性研究[D];內(nèi)蒙古大學(xué);2007年

2 王玫;小麥microRNA的鑒定與分析[D];南昌大學(xué);2007年

3 王天瑜;細(xì)胞中microRNA的分析及細(xì)胞形態(tài)研究[D];陜西師范大學(xué);2015年

4 崔豐磊;東鄉(xiāng)野生稻冷脅迫應(yīng)答microRNA的篩選及驗(yàn)證[D];江西師范大學(xué);2015年

5 蘇小蓉;干細(xì)胞中microRNA和靶基因相互作用的數(shù)據(jù)庫[D];南方醫(yī)科大學(xué);2015年

6 楊浩;人血清中衰老相關(guān)循環(huán)microRNA表達(dá)譜[D];南京大學(xué);2013年

7 康榮彥;慢病毒介導(dǎo)的shRNA通過干擾microRNA表達(dá)譜非特異抑制丙型肝炎病毒增殖的研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2012年

8 殷美琦;STTM干擾煙草內(nèi)源miRNAs體系的建立[D];電子科技大學(xué);2015年

9 劉瑩;昆蟲轉(zhuǎn)錄組中微小RNA的預(yù)測及其靶標(biāo)分析[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

10 許曉玲;響應(yīng)i*柑原生質(zhì)體分離過程中microRNA及其靶基因的鑒定和表達(dá)研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2015年

，

本文編號：1734354