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番茄KNOX基因家族鑒定及茄科作物KNOX基因進化關(guān)系分析

發(fā)布時間:2018-04-10 10:04

  本文選題:番茄 切入點:KNOX基因家族 出處:《核農(nóng)學(xué)報》2017年07期


【摘要】:為了探明番茄KNOX基因家族特征及茄科作物中KNOX的進化關(guān)系,利用生物信息學(xué)方法,在全基因組水平上對番茄及其它茄科作物KNOX基因家族成員進行鑒定和分析。結(jié)果表明,番茄基因組中共含有8個KNOX基因(Sl KNOX1~Sl KNOX8),分別分布在番茄8條染色體上;多序列比對發(fā)現(xiàn),除Sl KNOX5外,所有基因均含有同源異型盒蛋白特有的4種結(jié)構(gòu)域,即KNOX1、KNOX2、ELK和Homeobox KN。利用系統(tǒng)發(fā)育樹將茄科作物KNOX基因分為2類:ClassⅠ和ClassⅡ。茄科作物KNOX基因與擬南芥同源基因可能經(jīng)歷了不同的進化歷程,在茄科作物中,特有的進化分支(Class I C)已經(jīng)出現(xiàn)。qRTPCR分析發(fā)現(xiàn),番茄Sl KNOX1在花蕾和花中具有較高表達,在果實生長發(fā)育過程中表達量逐漸降低,Sl KNOX2~Sl KNOX4在果實生長發(fā)育過程中幾乎不表達,Sl KNOX6和Sl KNOX7在所測組織中均有表達,Sl KNOX8在果實成熟過程中表達量逐漸增加,且在根中表達量最大。本研究在全基因組水平上揭示了番茄中KNOX基因家族特征以及茄科作物中KNOX基因的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,為進一步揭示KNOX基因家族在番茄組織器官中的功能及進化模式奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to find out the characteristics of tomato KNOX gene family and the evolutionary relationship of KNOX in eggplant crops, the members of KNOX gene family of tomato and other eggplant crops were identified and analyzed on the whole genome level by bioinformatics.The KNOX gene of Solanaceae was divided into two groups: class 鈪,

本文編號:1730756

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