大鼠正畸牙移動中NF-κB通路相關(guān)差異基因的GO分析
本文選題:正畸牙移動 切入點:核轉(zhuǎn)錄因子κB 出處:《口腔醫(yī)學(xué)研究》2017年08期
【摘要】:目的:利用基因表達(dá)譜芯片對正畸加力組與正常大鼠牙齒牙周組織的基因表達(dá)譜進(jìn)行對比分析,篩選差異基因并進(jìn)行GO分析。方法:將6只SD大鼠隨機(jī)分為加力組和對照組,加力組建立大鼠正畸牙齒移動模型。根據(jù)預(yù)實驗結(jié)果,分別在0h、12h處死大鼠,并截取上頜第一磨牙及外周約1mm的牙周組織,提取總RNA,進(jìn)行全基因組表達(dá)譜芯片檢測,對差異表達(dá)基因進(jìn)行GO分析,并運用RT-qPCR對芯片結(jié)果進(jìn)行驗證。結(jié)果:芯片結(jié)果顯示,共篩選到463條差異基因,其中實驗組與對照組相比250個基因表達(dá)上調(diào),213個基因表達(dá)下調(diào),在差異基因中涉及到NF-κB信號通路的基因有8個,均表達(dá)上調(diào)。GO分析涉及到1189個不同的功能分類。結(jié)論:正畸加力12h后牙齒牙周組織中與炎癥反應(yīng)相關(guān)的基因和與中性粒細(xì)胞趨化相關(guān)的基因表達(dá)上調(diào)。
[Abstract]:Aim: to compare and analyze the gene expression profiles in periodontal tissues of orthodontic plus force group and normal rats by using gene expression microarray to screen differentially expressed genes and go analysis.Methods: six Sprague-Dawley rats were randomly divided into treatment group and control group.According to the experimental results, the rats were killed at 0 h and 12 h, the periodontal tissues of maxillary first molar and peripheral 1mm were cut off, the total RNAs were extracted, the whole genome expression microarray was detected, and the differentially expressed genes were analyzed by go.The chip results are verified by RT-qPCR.Results: a total of 463 differentially expressed genes were screened, among which 250 genes were up-regulated and 213 genes were down-regulated in the experimental group compared with the control group. There were 8 genes involved in NF- 魏 B signaling pathway in the differentially expressed genes.All up-regulated. Go analysis involved 1189 different functional classifications.Conclusion: the expression of genes related to inflammation and neutrophil chemotaxis in periodontal tissues is up-regulated 12 h after orthodontic stress.
【作者單位】: 南開大學(xué)醫(yī)學(xué)院;天津市口腔醫(yī)院正畸科;
【基金】:國家臨床重點?平ㄔO(shè)項目(口腔正畸專業(yè))批準(zhǔn)文號:國衛(wèi)醫(yī)辦函[2013]544號 天津市衛(wèi)生計生委科技基金重點攻關(guān)項目(編號:14KG132)
【分類號】:R783.5
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,本文編號:1727247
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