川金絲猴MHCⅡ類基因遺傳分析及其對(duì)配偶選擇的影響
發(fā)布時(shí)間:2018-04-01 22:00
本文選題:配偶選擇 切入點(diǎn):MHC 出處:《西北大學(xué)》2016年博士論文
【摘要】:了解物種的種群歷史與種群現(xiàn)在的遺傳多樣性狀況,為制定高效的保護(hù)策略起著十分重要的作用。適應(yīng)性遺傳變異是制定瀕危物種保護(hù)策略的一個(gè)重要參考依據(jù)。作為免疫系統(tǒng)的重要組成部分,主要組織相容性復(fù)合體(MHC)基因的變異水平能夠反映出_物種和進(jìn)化相關(guān)的適應(yīng)性潛能,因此已經(jīng)成為適應(yīng)性的遺傳變異研究典范。川金絲猴的社會(huì)體系是以一雄多雌社會(huì)單元(OMU)為基本組織結(jié)構(gòu)的重層社會(huì)體系,但常常出現(xiàn)單元外交配等現(xiàn)象。影響動(dòng)物婚配制度的因素,除社會(huì)結(jié)構(gòu)外,還有更深層次的分子機(jī)制。因此,探討川金絲猴配偶選擇的分子機(jī)制具有重要意義。MHC基因做為研究物種配偶選擇機(jī)制的最適標(biāo)記已經(jīng)在多個(gè)物種中應(yīng)用。本論文分別選用MHC Ⅱ類基因的DQA1、DQB1、DPB1和DRB的第二外顯子進(jìn)行研究,重點(diǎn)分析了MHC基因的多態(tài)性及歷史選擇作用等,從而希望能更為全面的獲悉川金絲猴適應(yīng)性遺傳變異的情況,并預(yù)測(cè)其適應(yīng)性進(jìn)化的潛力,進(jìn)而為保護(hù)策略的制定提供重要參考依據(jù)。研究還通過(guò)MHC II類基因的分離及目標(biāo)個(gè)體的基因分型來(lái)探討川金絲猴中是否存在基于MHC的配偶選擇,這對(duì)于闡明該物種的配偶選擇機(jī)制有重要的理論價(jià)值。本研究從秦嶺北坡的玉皇廟地區(qū)采集到川金絲猴西梁群體的136個(gè)樣本,分別獲得了6條Rhro-DPBI等位基因(Rhro-DPBI*01、02、03、04、05和06)、5條Rhro-DQA1等位基因(Rhro-DQA1*01、02、03、05和08)、5條Rhro-DQB1等位基因(Rhro-DQB1*01、04、08、09和17)和7條Rhro-DRB等位基因(Rhro-DRB*02、03、05、06、08、09和34)。其中,等位基因Rhro-DPBI W1、02、03、04、05、06是首次獲得的。所有的等位基因中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)終止密碼子、讀碼框變異和插入或缺失(除了Rhro-DPB1*03有3個(gè)核苷酸的缺失,導(dǎo)致第58個(gè)氨基酸缺失)。研究表明雖然經(jīng)歷了嚴(yán)重的種群衰退和生境破碎化,川金絲猴的DQA1和DQBJ7基因仍表現(xiàn)出較高的多態(tài)性,DPB1基因保持著中度的多態(tài)性。系統(tǒng)發(fā)生分析發(fā)現(xiàn)DPB1、DQA1、DQB1和DRB均表現(xiàn)出跨物種多態(tài)的特點(diǎn)。在選擇壓力分析中發(fā)現(xiàn)DPB1和DRB基因曾經(jīng)受到過(guò)較強(qiáng)的正選擇作用,DQB1基因也在進(jìn)化中受到過(guò)一定程度的選擇壓力。在所研究的川金絲猴群體中存在著MHC依賴性的配偶選擇。對(duì)MHC各等位基因在雄性群體中頻率的卡方檢驗(yàn)和擬合優(yōu)度檢驗(yàn)共同表明了雌性的配偶選擇符合“好基因假說(shuō)”,雌性個(gè)體在配偶選擇過(guò)程中傾向于具有等位基因Rhro-DQA1*02的雄性個(gè)體。另外,等位基因Rhro-DQB1*17也在一定程度上表現(xiàn)出了“好基因”的特點(diǎn)。但沒(méi)有顯著的證據(jù)表明在該群體中雌性的配偶選擇符合“雜合子優(yōu)勢(shì)假說(shuō)”和“異型交配假說(shuō)”。
[Abstract]:Understanding the population history of species and the current genetic diversity of populations, Adaptive genetic variation is an important reference for the development of conservation strategies for endangered species. As an important part of the immune system, adaptive genetic variation plays an important role in the development of efficient conservation strategies. The level of variation in the major histocompatibility complex (MHC) gene can reflect the adaptive potential associated with species and evolution. Therefore, it has become an example of genetic variation in adaptability. The social system of Sichuan Golden Monkey is a restratified social system with one male and more female social units as its basic organizational structure. However, there are often phenomena such as extraunit mating. The factors that influence the animal mating system are not only the social structure, but also the deeper molecular mechanism. It is very important to study the molecular mechanism of mate selection of Sichuan golden monkey. MHC gene has been used in many species as the most suitable marker to study the mechanism of mate selection. In this paper, DQA1, DQB1, DQB1, DPB1 and DPB1 of MHC 鈪,
本文編號(hào):1697454
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