番木瓜成熟衰老蛋白基因CpSSA的克隆與表達(dá)分析
本文選題:番木瓜 切入點(diǎn):衰老相關(guān)蛋白 出處:《分子植物育種》2017年04期
【摘要】:衰老相關(guān)蛋白(senescence-associated protein,SSA)基因在果實(shí)成熟衰老中起重要作用。為了探究番木瓜衰老相關(guān)蛋白基因,以‘大白八號(hào)’番木瓜果實(shí)為材料,采用RACE技術(shù)擴(kuò)增出番木瓜SSA基因全長cDNA序列,命名為CpSSA(登錄號(hào):KX885408)。生物信息學(xué)分析顯示,CpSSA全長1 203 bp,包含一個(gè)420 bp的開放性閱讀框。番木瓜SSA蛋白含有139個(gè)氨基酸,分子質(zhì)量為15.172 4 kD,等電點(diǎn)為9.61。該蛋白的氨基酸序列與桃、葡萄、楊樹、菠菜的氨基酸序列有較高的同源性。系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,番木瓜SSA與葡萄SSA表現(xiàn)出最小的進(jìn)化距離,親緣關(guān)系最接近。用熒光定量PCR分析在不同處理不同成熟度番木瓜果實(shí)中CpSSA基因的表達(dá)差異,結(jié)果顯示在乙烯處理后的6 h和12 h表達(dá)量顯著升高,在1-MCP處理中表達(dá)量較低,在乙烯/1-MCP處理果實(shí)中的表達(dá)模式與成熟衰老有一定相關(guān)性,推測(cè)CpSSA基因可能參與了番木瓜果實(shí)的成熟衰老進(jìn)程。
[Abstract]:Senescence-associated protein (SSA) gene plays an important role in fruit senescence. In order to investigate the senescence related protein gene of papaya, the full-length cDNA sequence of papaya SSA gene was amplified by RACE. CpSSA was named as CpSSA (accession number: KX885408). Bioinformatics analysis showed that CpSSA was 1 203 BP in length and contained a 420bp open reading frame. Papaya SSA protein contained 139 amino acids, molecular weight was 15.172 kD and isoelectric point was 9.61.The amino acid sequence of CpSSA was similar to that of peach. The amino acid sequences of grape, poplar and spinach have high homology. Phylogenetic tree shows that papaya SSA has the smallest evolutionary distance from grape SSA. The results showed that the expression of CpSSA gene was significantly increased at 6 and 12 hours after ethylene treatment, but low in 1-MCP treatment. The expression pattern of ethylene / 1-MCP was correlated with maturation and senescence, which suggested that CpSSA gene might be involved in the ripening and senescence process of papaya fruit.
【作者單位】: 福建農(nóng)林大學(xué)園藝學(xué)院;福建農(nóng)林大學(xué)園藝植物遺傳育種研究所;
【基金】:福建農(nóng)林大學(xué)園藝學(xué)院青年學(xué)術(shù)骨干培養(yǎng)基金項(xiàng)目(FAFU2012YYPY05)資助
【分類號(hào)】:Q943.2;S667.9
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