植物顆粒結(jié)合淀粉合酶GBSS基因家族的進(jìn)化
本文選題:基因組 切入點(diǎn):系統(tǒng)發(fā)育 出處:《植物學(xué)報(bào)》2017年02期
【摘要】:為全面理解植物顆粒結(jié)合淀粉合酶(GBSS)基因在植物中的進(jìn)化模式并重建其進(jìn)化歷史,利用20種陸生植物和2種藻類植物的基因組數(shù)據(jù),通過(guò)生物信息學(xué)手段,深入挖掘和分析植物類群基因組中GBSS基因家族的構(gòu)成和基因特點(diǎn),推測(cè)其可能的擴(kuò)增和丟失規(guī)律。結(jié)果共識(shí)別42條同源序列。系統(tǒng)發(fā)育和進(jìn)化分析表明,GBSS基因起源古老,可能在所有綠色植物的祖先中就已經(jīng)出現(xiàn),之后在進(jìn)化過(guò)程中不斷發(fā)生譜系的特異擴(kuò)張和拷貝丟失,并最終通過(guò)功能分化的形式在植物類群中被固定。
[Abstract]:In order to fully understand the evolutionary model of granular-bound starch synthase (GBSS) gene in plants and to reconstruct its evolutionary history, the genome data of 20 terrestrial plants and 2 species of algae were used by bioinformatics. The composition and characteristics of GBSS gene family in plant genomes were deeply explored and analyzed, and the possible amplification and loss rules were speculated. Results 42 homologous sequences were identified. Phylogenetic and evolutionary analysis showed that the origin of GBSS gene was ancient. It may have been found in the ancestors of all green plants, followed by a series of lineage specific expansion and copy loss during evolution, and eventually fixed in the plant community through functional differentiation.
【作者單位】: 曲阜師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(No.31570218)
【分類號(hào)】:Q946
【相似文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前5條
1 戴衛(wèi)列,鄧煒,崔偉英,趙壽元,汪訓(xùn)明;馬鈴薯GBSS基因的克隆與DNA順序分析[J];植物學(xué)報(bào);1996年10期
2 宋東光,黃大慶,王光清,汪訓(xùn)明;不同長(zhǎng)度馬鈴薯GBSS基因啟動(dòng)子的塊莖專一性表達(dá)的初報(bào)[J];復(fù)旦學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);1998年04期
3 藍(lán)曉東,汪訓(xùn)明;馬鈴薯P_(GBSS)-GUS融合基因在塊莖中專一性表達(dá)的初步研究[J];復(fù)旦學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);1997年05期
4 陳國(guó)梁;張金文;王蒂;;馬鈴薯gbss、ssⅡ和ssⅢ基因片段的融合及其RNAi載體的構(gòu)建[J];中國(guó)生物工程雜志;2008年08期
5 ;[J];;年期
相關(guān)會(huì)議論文 前3條
1 李良俊;陸葉;陳學(xué)好;;蓮藕GBSS基因的克隆與表達(dá)的初步研究[A];慶祝中國(guó)園藝學(xué)會(huì)創(chuàng)建80周年暨第11次全國(guó)會(huì)員代表大會(huì)論文摘要集[C];2009年
2 ;Factors affecting degree of polymerization of GBSS1 in Oryza sativa L.and their roles in increasing its enzymatic activity[A];從植物科學(xué)到農(nóng)業(yè)發(fā)展——2012全國(guó)植物生物學(xué)大會(huì)論文集[C];2012年
3 王春萍;高麗鵑;潘志芬;鄧光兵;龍海;唐亞偉;尼瑪扎西;余懋群;;青藏高原農(nóng)家青稞淀粉顆粒結(jié)合蛋白及GBSS/基因5'前導(dǎo)序列多態(tài)性研究[A];中國(guó)作物學(xué)會(huì)50周年慶祝會(huì)暨2011年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2011年
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前7條
1 朱立楠;水稻超親變異系胚乳GBSS1和ISAs基因表達(dá)特性及對(duì)氮素響應(yīng)分析[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
2 郭華;小麥顆粒結(jié)合淀粉合成酶(GBSS)結(jié)合特性與模擬構(gòu)象研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2006年
3 李洲;以GBSS、SSⅢ、SSⅡ基因?yàn)榘袠?biāo)的RNAi載體對(duì)馬鈴薯的轉(zhuǎn)化及鑒定[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年
4 藺琰東;馬鈴薯GBSSⅠ基因的ihpRNAi載體轉(zhuǎn)化試管薯片及轉(zhuǎn)基因塊莖相關(guān)生理指標(biāo)分析[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年
5 苗建利;高溫與干旱脅迫對(duì)小麥籽粒GBSS活性、淀粉品質(zhì)及產(chǎn)量的影響[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年
6 劉玉匯;Patatin啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的馬鈴薯GBSSⅠ基因ihpRNAi植物表達(dá)載體的構(gòu)建及轉(zhuǎn)化馬鈴薯的研究[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年
7 陳國(guó)梁;以gbss、ssⅢ和ssⅡ?yàn)榘袠?biāo)的RNAi載體構(gòu)建及轉(zhuǎn)基因馬鈴薯植株的獲得[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年
,本文編號(hào):1663516
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/1663516.html