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中國大陸1993~2013年流行的麻疹病毒H1基因型血凝素基因變異特征

發(fā)布時間:2018-03-24 13:17

  本文選題:麻疹病毒 切入點:血凝素 出處:《病毒學報》2017年02期


【摘要】:為探討2013年引起中國大陸麻疹復(fù)發(fā)的麻疹野病毒中和抗原血凝素(Hemagglutinin,HA)的變異動態(tài),本研究對1993~2013年中國大陸流行的麻疹病毒H1基因型血凝素(HA)編碼基因和氨基酸變異進行系統(tǒng)分析,為評價中國疫苗對2013年流行的麻疹野病毒的保護效果提供科學依據(jù)。選取2013年8株麻疹病毒代表株,擴增HA基因編碼區(qū)序列(1 854bp)并進行序列測定和分析。從GenBank上下載45株1993~2012年中國流行株、中國疫苗株上海191(S-191)和長春47(C-47)和24株WHO參考株HA基因編碼區(qū)序列,MEGA5.05構(gòu)建親緣關(guān)系樹和進行氨基酸位點比對,分析重要中和抗原位點的變異。使用BioEdit進行同源性關(guān)系分析。根據(jù)HA基因序列的親緣性關(guān)系分析,2013年麻疹病毒代表株均位于H1a亞型的第3分支,且2000年以后分離的H1a亞型的麻疹野毒株均屬于該分支;8株2013年麻疹病毒代表株核苷酸和氨基酸的同源性分別為97.6%~99.8%和97.8%~100.0%,與1993~2012年H1a基因亞型麻疹病毒的核苷酸和氨基酸同源性分別為97.6%~99.6%和97.0%~99.6%,與中國疫苗株S-191和C-47的核苷酸和氨基酸同源性分別為94.3%~94.7%和94.6%~95.4%;與中國疫苗株S-191原型野病毒氨基酸序列比對,1993~2013年麻疹病毒代表株HA主要中和抗原位點未發(fā)生重大變異,但包括2013年代表株的近年流行的H1a麻疹毒株在氨基酸第240位由絲氨酸突變成了天冬酰胺(Ser240Asn),導(dǎo)致潛在的糖基化位點NLS238~240的缺失,但H1基因型麻疹病毒均保留有4個潛在的糖基化位點。中國大陸流行的麻疹病毒H1基因型在重要的中和抗原位點均保持穩(wěn)定,中國使用的麻疹疫苗對中國現(xiàn)流行的麻疹病毒H1a亞型具有較好的保護效果。中國應(yīng)繼續(xù)加強流行麻疹病毒血凝素基因的動態(tài)監(jiān)測,以評價我國疫苗對流行麻疹野病毒的保護效果,為我國消除麻疹提供疫苗使用的科學依據(jù)。
[Abstract]:In order to investigate the variation dynamics of hemagglutinin (HA), a wild measles virus neutralizing antigen, which caused measles recurrence in mainland China in 2013, the coding gene and amino acid variation of measles virus H1 genotype hemagglutinin (H1) in mainland China from 1993 to 2013 were systematically analyzed. In order to provide scientific basis for evaluating the protective effect of Chinese vaccine on wild measles virus in 2013, 8 representative measles virus strains were selected in 2013. The coding region of HA gene was amplified and sequenced and analyzed. 45 epidemic strains from 1993 to 2012 were downloaded from GenBank. Chinese vaccine strains Shanghai 191 S-191) and Changchun 47 C 47) and 24 WHO reference strains of HA gene coding region sequence of MEGA 5.05 constructed a phylogenetic tree and amino acid site alignment. BioEdit was used for homology analysis. According to the genetic relationship analysis of HA gene sequence, the representative strains of measles virus in 2013 were all located in the third branch of H1 a subtype. And the nucleotide and amino acid homology of all the wild measles viruses isolated after 2000 were 97.699.8% and 97.8%, respectively, which were similar to the nucleotides and amino acids of H1 a gene subtype measles virus from 1993 to 2012. The homology of nucleotide and amino acid of the representative strains of measles virus in 2013 were 97.699.8% and 97.8100.0, respectively, which were similar to those of H1 a gene subtype measles virus from 1993 to 2012. The nucleotide and amino acid homology with Chinese vaccine strain S-191 and C-47 were 94.33.7% and 94.6%, respectively. The amino acid sequence of Chinese vaccine strain S-191 prototype wild virus was compared with the amino acid sequence of Chinese vaccine strain S-191. There was no significant variation in the site. However, the recently prevalent H1N1 measles strain, including the representative strain of 2013, changed from serine process to Ser240Asnn in amino acid at 240th, resulting in the deletion of potential glycosylation site NLS238~240. However, the H1 genotype of measles virus had four potential glycosylation sites. The H1 genotype of measles virus in mainland China remained stable at the important neutralizing antigen sites. The measles vaccine used in China has a good protective effect on the current epidemic measles virus H1N1 subtype in China. China should continue to strengthen the dynamic surveillance of the hemagglutinin gene of the epidemic measles virus. In order to evaluate the protective effect of Chinese vaccine on epidemic measles wild virus and provide scientific basis for measles elimination in China.
【作者單位】: 中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所衛(wèi)生部醫(yī)學病毒病重點實驗室世界衛(wèi)生組織西太平洋區(qū)麻疹參比實驗室;
【基金】:國家自然科學基金(項目號:81371791),題目:麻疹病毒血凝素蛋白分子進化、抗原變異及其對我國疫苗保護效果的影響
【分類號】:R511.1

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