綿羊IGF-Ⅰ基因剪接異構(gòu)體克隆及生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2018-03-24 03:10
本文選題:動(dòng)物遺傳育種與繁殖 切入點(diǎn):綿羊 出處:《中國(guó)科技論文》2017年12期
【摘要】:胰島素樣生長(zhǎng)因子-1(insulin like growth factor I,IGF-Ⅰ)是機(jī)體重要的生長(zhǎng)因子,可作為培育高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)的毛用、肉用家畜新品種時(shí)重要的候選基因,但其在轉(zhuǎn)錄過(guò)程中存在著選擇性剪接現(xiàn)象。本研究成功克隆得到了綿羊IGF-Ⅰ基因Ⅰ類Ea型和Eb型兩種剪接異構(gòu)體,并結(jié)合生物信息學(xué)方法對(duì)其結(jié)構(gòu)與功能進(jìn)行分析。研究結(jié)果表明,克隆得到的綿羊IGF-Ⅰ基因Ⅰ類Ea型與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)信息相一致,預(yù)測(cè)編碼154個(gè)氨基酸;IGF-Ⅰ基因Ⅰ類Eb型為新發(fā)現(xiàn)的剪接異構(gòu)體,預(yù)測(cè)編碼188個(gè)氨基酸。信號(hào)肽分析顯示兩剪接異構(gòu)體均在49~50位氨基酸處存在潛在的信號(hào)肽切割位點(diǎn);系統(tǒng)進(jìn)化樹分析顯示兩種剪接異構(gòu)體在進(jìn)化上均與哺乳動(dòng)物更為接近,與靈長(zhǎng)類、嚙齒類和兩棲類較遠(yuǎn);蛋白理化性質(zhì)分析顯示,兩剪接異構(gòu)體在等電點(diǎn)及親疏水性上存在部分差異,但總體上表明疏水性較弱,親水性較強(qiáng),為親水性氨基酸;亞細(xì)胞定位結(jié)果表明二者均為分泌型蛋白質(zhì),主要存在于分泌途徑;兩剪接異構(gòu)體均存在兩個(gè)跨膜螺旋,但不存在明顯的跨膜區(qū),不是跨膜蛋白,二者含有不同數(shù)量的糖基化位點(diǎn)和磷酸化位點(diǎn);蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)分析顯示兩剪接異構(gòu)體均以α-螺旋為主,蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)分析顯示為明顯的彎曲狀螺旋結(jié)構(gòu)。
[Abstract]:Insulin like growth factor IGF- 鈪,
本文編號(hào):1656437
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