沉默MCM7基因后肝癌SMMC-7721細(xì)胞差異表達(dá)基因的篩選
本文選題:肝癌 切入點(diǎn):MCM 出處:《世界華人消化雜志》2016年10期
【摘要】:目的:探究微小染色體維持蛋白7(minichromosome maintenance protein 7,MCM7)基因在調(diào)節(jié)肝癌細(xì)胞生長(zhǎng)的相關(guān)機(jī)制.方法:通過(guò)s i R N A干擾技術(shù)沉默人肝癌SMMC-7721細(xì)胞中的MCM7基因表達(dá),采用人全基因組表達(dá)譜芯片,篩查MCM7沉默后差異表達(dá)基因,進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并對(duì)部分差異表達(dá)基因進(jìn)行蛋白免疫印跡法(Western blot)驗(yàn)證.結(jié)果:芯片篩選出在人肝癌SMMC-7721細(xì)胞中沉默MCM7基因后差異表達(dá)基因1010個(gè),其中上調(diào)基因391個(gè),下調(diào)基因619個(gè).這些基因主要涉及生物大分子代謝、細(xì)胞周期調(diào)控、細(xì)胞增殖、細(xì)胞凋亡等方面,參與胞吞、腫瘤相關(guān)通路、P53信號(hào)通路、mTOR信號(hào)通路等通路的改變.Western blot對(duì)部分差異基因表達(dá)驗(yàn)證的結(jié)果顯示CCND1、SKP2和JUP蛋白表達(dá)均下調(diào),與芯片檢測(cè)結(jié)果一致.結(jié)論:應(yīng)用人基因表達(dá)譜芯片,成功篩選出沉默MCM7基因后人肝癌細(xì)胞SMMC-7721差異表達(dá)基因,為探究MCM7基因影響肝癌細(xì)胞生長(zhǎng)提供了有效線索.
[Abstract]:Aim: to investigate the mechanism of the microchromosome maintenance protein 7(minichromosome maintenance protein 7 (MCM7) gene in regulating the growth of hepatocellular carcinoma cells. Methods: the expression of MCM7 gene in human hepatocellular carcinoma SMMC-7721 cells was silenced by sirna interference technique. Human genome expression microarray was used to screen differentially expressed genes after MCM7 silencing and bioinformatics analysis was carried out. Results: 1010 differentially expressed genes were screened by microarray after silencing MCM7 gene in human hepatocellular carcinoma SMMC-7721 cells, including 391 up-regulated genes. These genes are mainly involved in the metabolism of biomolecules, cell cycle regulation, cell proliferation, apoptosis and so on. Tumor related Pathway: p53 signaling Pathway / mTOR signaling Pathway. The results of partial differential gene expression verification by Western blot showed that the expression of CCND1- SKP2 and JUP were down-regulated, which was consistent with the results of microarray detection. Conclusion: human gene expression microarray was used. The differentially expressed SMMC-7721 genes of human hepatoma cells with silencing MCM7 gene were successfully screened, which provided an effective clue to explore the effect of MCM7 gene on the growth of HCC cells.
【作者單位】: 廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院實(shí)驗(yàn)研究部;廣西醫(yī)科大學(xué)研究生學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目,No.81260080 廣西自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目,No.2013GXNSFAA019210~~
【分類號(hào)】:R735.7
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,本文編號(hào):1654600
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