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應用Ion Torrent測序技術平臺對乳腺癌組織中PIK3CA基因突變區(qū)域的研究

發(fā)布時間:2018-03-23 11:07

  本文選題:乳腺癌 切入點:PIK3CA 出處:《吉林大學》2017年碩士論文


【摘要】:研究目的乳腺癌是我國女性最常見的惡性腫瘤,發(fā)病率居于我國女性惡性腫瘤的首位,并且目前仍呈現(xiàn)逐年上升的趨勢。PIK3CA基因突變是乳腺癌中最常見的基因突變之一,該以基因擴增或突變等形式激活,并通過PI3K/Akt信號通路,過度激活絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶AKT,將促進細胞無限制地生長和繁殖,并會抑制細胞凋亡,與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關。本研究通過對281例浸潤性乳腺癌以及30例乳腺良性腫瘤冰凍組織應用Ion Torrent測序平臺技術檢測PIK3CA基因突變情況,通過對臨床和病理資料的搜集和整理,旨在研究PIK3CA基因突變與乳腺癌臨床病例特征之間的關系。以期PIK3CA基因突變檢測對指導臨床個體化治療有所貢獻。材料與方法1.標本及資料收集:所有研究對象均獲知情同意。281例原發(fā)性浸潤性乳腺癌以及30例乳腺良性腫瘤的冰凍組織,取自吉林大學中日聯(lián)誼醫(yī)院乳腺外科2011年3月至2015年3月收治的手術患者。所取腫瘤組織均在切除后15分鐘之內(nèi)編號記錄并放入液氮保存,并在術后石蠟切片病理證實后放入-80℃冰箱保存。所有研究對象均有完整的臨床及病理資料以及免疫組化結果。2.實驗方法:281例乳腺癌腫瘤組織標本提取DNA后,經(jīng)過濃度及純度初步測定合格后,根據(jù)Life Technology公司相應的標準操作流程對DNA樣本進行文庫構建、模板制備、模板富集之后在Ion Proton System上進行測序。并對Ion Torrent測序數(shù)據(jù)進行質(zhì)控和分析。通過TUTE對突變位點進行注釋。3.統(tǒng)計學分析:研究數(shù)據(jù)應用SPSS23.0軟件進行統(tǒng)計學分析,組間差異性分布分析采用多個獨立樣本非參數(shù)檢驗,組間率的比較采用卡方檢驗。以P0.05為差異有統(tǒng)計學意義,P0.05為差異無統(tǒng)計學意義。實驗結果1.在281例乳腺癌患者中共108例(突變率38.4%)患者的癌組織中檢測到PIK3CA基因致病突變,其中95.6%聚集在9號、20號外顯子。2.PIK3CA基因的致病突變在患者腫瘤大小、淋巴結狀態(tài)、組織學分級、PR狀態(tài)、HER2表達之間無明顯差異(P0.05)。PIK3CA基因突變情況與ER狀態(tài)存在顯著相關性(χ2=6.501,p=0.011)。3.PIK3CA基因的9號、20號外顯子突變在患者腫瘤大小、淋巴結狀態(tài)、組織學分級、PR狀態(tài)、HER2表達之間無明顯差異(P0.05)。但在ER狀態(tài)不同的患者中存在顯著差異(χ2=7.387,p=0.007)。實驗結論1、本研究入選281例浸潤性乳腺癌患者腫瘤組織進行PIK3CA基因突變檢測,PIK3CA基因致病突變率38.4%,出現(xiàn)9號、20號外顯子突變例數(shù)達到全部PIK3CA基因致病突變的95.6%。20號外顯子突變率明顯高于9號外顯子。2、PIK3CA基因突變與乳腺癌患者腫瘤大小、淋巴結病理狀態(tài)、組織學分級、PR+/PR-,HER2是否表達無明顯相關。但該基因突變與ER+/ER-狀態(tài)存在顯著相關性。3、PIK3CA基因的9號、20號外顯子突變在患者腫瘤大小、淋巴結狀態(tài)、組織學分級、PR狀態(tài)、HER2表達之間無明顯差異。但在ER狀態(tài)不同的患者中存在顯著差異。4、PI3K/Akt信號通路與乳腺癌發(fā)生及進展密切相關,實時監(jiān)測PIK3CA基因的突變狀態(tài),并進一步明確PI3K/Akt信號通路激活狀態(tài),及時調(diào)整治療方案,尋找精確而有效的療效決策因子或?qū)⒊蔀檎麄乳腺癌個體化治療的重要課題之一。5、Ion Torrent測序技術具有操作簡單,測序速度快、測序精度高、測序成本低等優(yōu)勢,尤其適用于全面篩查具有高度特異性的腫瘤基因,以更好的指導患者的治療,提高治療效果,適合在臨床大規(guī)模應用。
[Abstract]:Objective breast cancer is the most common malignant tumors of women in our country, the incidence rate in China's first female malignancy, and still showed a trend of increasing.PIK3CA gene mutation is the most common mutation in breast cancer, to activate the gene amplification and mutation and other forms, and through the PI3K/Akt signaling pathway, excessive the activation of serine / threonine protein kinase AKT, will promote cell unrestricted growth and reproduction, and inhibition of apoptosis is closely related with the occurrence and development of tumors. This study of 281 cases of invasive breast cancer and 30 cases of benign breast tumor frozen tissue sequencing platform technology using Ion Torrent to detect the mutation of PIK3CA gene, through the to collect and collate the clinical and pathological data, to study the relationship between PIK3CA gene mutation and clinical characteristics of breast cancer. In order to detect PIK3CA gene mutation Clinical individual treatment contribute. Materials and methods 1. samples and data collection: all subjects had given informed consent.281 cases of primary invasive breast cancer and 30 cases of benign breast tumor patients with frozen tissue, from March 2011 to March 2015 were breast surgery of Jilin University in China Japan union hospital. The tumor tissues were save in resection within 15 minutes after the record number and placed in liquid nitrogen, and postoperative paraffin pathology in -80 C refrigerator. All of the subjects had complete clinical and pathological data and immunohistochemical results of.2. methods: 281 cases of breast cancer tumor tissue specimens after DNA extraction, after the preliminary determination of purity and concentration after passing, according to Life Technology's corresponding standard operating procedures for construction of DNA Library of sample preparation, template, template concentration after Ion Proton Sy Stem for sequencing. And quality control and analysis of Ion Torrent sequencing data. Through the TUTE mutation analysis of.3. statistical software data annotation: a study of application of SPSS23.0 for statistical analysis, the differences between groups of distribution analysis using multiple independent samples nonparametric test, rate comparison between groups using chi square test with P0.05. The difference was statistically significant, P0.05 was no significant difference. Results 1. in 281 cases of breast cancer patients in 108 cases (mutation rate 38.4%) mutation detection of PIK3CA gene of pathogenic in patients with cancer, 95.6% of them gathered in No. 9, exon 20 of.2.PIK3CA gene mutation in patients with tumor size, lymph node status, histological grade, PR status, no significant difference between the expression of HER2 (P0.05).PIK3CA gene mutation and ER status showed significant correlation (2=6.501, p=0.011).3.PIK3CA gene of No. 9, No. 20 The mutation of exon size in patients with tumor, lymph node status, histological grade, PR status, no significant difference between the expression of HER2 (P0.05). But there were significant differences in the different status of the ER patients (2=7.387, p=0.007). Conclusions: 1. This study selected 281 cases of invasive breast cancer tissue gland cancer detection of mutations in the PIK3CA gene, PIK3CA gene mutation rate was 38.4%, 9, 20 exon mutation cases reach all the causative mutation in the PIK3CA gene 95.6%.20 mutation in exon 9 was significantly higher than that of exon.2, PIK3CA gene mutation and tumor size in patients with breast cancer, lymph node pathology, histology PR+/PR-, grading, HER2 expression had no significant correlation. But the significant correlation between.3 gene mutation and ER+/ER-, PIK3CA gene 9, exon 20 mutation in patients with tumor size, lymph node status, histological grade, PR status, HER2 No significant difference between the expression of.4. But there were significant differences in the different status of the ER patients, PI3K/Akt signaling pathway and breast cancer incidence and progression is closely related to PIK3CA gene mutation status real-time monitoring, and further clarify the activation of the PI3K/Akt signaling pathway, adjust the treatment plan in a timely manner, to find effective and accurate decision-making factor effect or will become one of the important topics in the.5 of breast cancer treatment, Ion Torrent sequencing technology has the advantages of simple operation, fast speed and high precision sequencing, sequencing, sequencing of the advantages of low cost, especially suitable for the comprehensive screening of tumor gene has high specificity, in order to better guide the treatment of patients, improve the therapeutic effect, suitable for clinical scale application.

【學位授予單位】:吉林大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:R737.9

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本文編號:1653191


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