甘薯低溫脅迫基因IbICE1的克隆及表達(dá)分析
本文選題:甘薯 切入點(diǎn):IbICE 出處:《沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年02期 論文類型:期刊論文
【摘要】:克隆甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)低溫脅迫基因Ib ICE1,對其進(jìn)行序列分析及低溫脅迫下表達(dá)水平分析,探討Ib ICE1對甘薯耐低溫脅迫能力的影響。以遼薯36為試驗(yàn)材料,利用RACE技術(shù)克隆甘薯Ib ICE1基因,Ib ICE1基因的c DNA全長2150bp,包含1611bp完整的開放閱讀框,該基因編碼536個(gè)氨基酸殘基,分子量58.26 k D,等電點(diǎn)5.72。進(jìn)化樹分析表明,Ib ICE1同玉米和擬南芥ICE1基因親緣關(guān)系較近。Ib ICE1蛋白C端含有一個(gè)典型的b HLH結(jié)構(gòu)域,并與其他植物的ICE1蛋白具有較高的同源性。采用RT-PCR研究該基因在低溫處理時(shí)的表達(dá)量及在甘薯不同組織中的表達(dá)量,結(jié)果表明,該基因的表達(dá)受低溫脅迫誘導(dǎo),在甘薯的莖、葉和根均有表達(dá),其中葉中表達(dá)量最高,推測Ib ICE1基因在甘薯耐低溫脅迫中發(fā)揮重要作用。
[Abstract]:The low temperature stress gene Ib ICE1 of Ipomoea batatas L. Lam. was cloned and sequenced and the expression level of Ib ICE1 was analyzed to study the effect of Ib ICE1 on the tolerance of sweet potato to low temperature stress. The c DNA of Ib ICE1 gene Ib ICE1 gene of sweet potato was cloned by RACE technique, containing a complete open reading frame of 1611bp. The gene encodes 536 amino acid residues. The molecular weight was 58.26kD and the isoelectric point was 5.72.The phylogenetic tree analysis showed that Ib ICE1 was closely related to the ICE1 gene of maize and Arabidopsis thaliana. The C-terminal of Ib ICE1 protein contained a typical b HLH domain. RT-PCR was used to study the expression of ICE1 protein in different tissues of sweet potato under low temperature treatment. The results showed that the expression of the gene was induced by low temperature stress and was induced in stem of sweet potato. The expression of Ib ICE1 gene was the highest in leaves and roots, suggesting that Ib ICE1 gene played an important role in the tolerance to cold stress in sweet potato.
【作者單位】: 遼寧省農(nóng)業(yè)科學(xué)院;
【基金】:國家“863”計(jì)劃專題項(xiàng)目(2012AA101204)
【分類號】:S531
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