白骨壤重金屬耐受性相關基因AmNramp3的克隆與分析
本文選題:白骨壤 切入點:重金屬耐受性 出處:《廈門大學學報(自然科學版)》2017年03期 論文類型:期刊論文
【摘要】:白骨壤(Avicennia marina(Forsk.)Vierh.)作為紅樹林的先鋒植物,廣泛分布于我國南海沿岸,是一種研究紅樹植物重金屬污染物耐受性分子機制很好的材料.以抑制消減雜交獲得的白骨壤重金屬耐受性相關基因AmNramp3片段為基礎,設計基因特異性引物,利用cDNA末端快速擴增(RACE)技術克隆了其全長,長度為1 958bp;通過實時熒光定量PCR(qRT-PCR)檢測了AmNramp3在重金屬鎘脅迫時白骨壤葉、莖和根中的表達情況,其表達量在葉中高于根和莖中,但在莖和根中有快速的響應.利用生物信息學方法預測并分析了該基因的開放閱讀框,位置位于1~1 527bp,編碼508個氨基酸;進而預測并分析了AmNramp3蛋白的結構,發(fā)現(xiàn)其氨基酸序列中不含有信號肽,說明其不是分泌蛋白;但其具有很復雜的跨膜結構,是一種跨膜蛋白.綜上,AmNramp3基因編碼一種跨膜蛋白,在重金屬鎘脅迫下表達量快速變化,可能與鎘的跨膜運輸密切相關,這為后續(xù)分析該基因發(fā)揮功能的分子機制奠定了基礎.
[Abstract]:As a pioneer plant of mangroves, Avicennia marinaena Forsk.Vierh.is widely distributed along the coast of South China Sea in China. It is a good material to study the molecular mechanism of heavy metal pollutant tolerance in mangrove plants. Based on the AmNramp3 fragment of heavy metal tolerance related gene obtained by suppression subtractive hybridization, a gene specific primer was designed. The length of cDNA was 1 958 bp.The expression of AmNramp3 in leaves, stems and roots of white bone soil under cadmium stress was detected by real-time fluorescence quantitative PCR qRT-PCR.The expression of AmNramp3 in leaves, stems and roots was higher than that in leaves and stems. But there was a rapid response in stem and root. The open reading frame of the gene was predicted and analyzed by bioinformatics, which was located at 1 527 BP, encoding 508 amino acids, and the structure of AmNramp3 protein was predicted and analyzed. It was found that its amino acid sequence did not contain a signal peptide, indicating that it was not a secretory protein, but it had a very complex transmembrane structure and was a transmembrane protein. It may be closely related to the transmembrane transport of cadmium, which lays the foundation for further analysis of the molecular mechanism of the function of the gene.
【作者單位】: 廈門大學環(huán)境與生態(tài)學院;四川農業(yè)大學生命科學學院;
【基金】:國家自然科學基金(31530008,31370516)
【分類號】:Q943.2
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,本文編號:1642305
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