大熊貓嗅覺受體基因家族的生物信息學(xué)分析
本文選題:大熊貓 切入點:嗅覺受體 出處:《四川動物》2017年01期 論文類型:期刊論文
【摘要】:嗅覺受體(OR)在嗅覺系統(tǒng)識別氣味的過程中起關(guān)鍵作用,哺乳動物OR蛋白由其最大的多基因家族編碼。本研究深入分析了大熊貓Ailuropoda melanoleuca的OR基因家族,結(jié)果顯示大熊貓有1 048個OR基因,包括645個完整基因、219個假基因和184個片段基因。大熊貓的OR基因根據(jù)序列相似性可劃分為22個家族、240個亞家族,平均每個亞家族的成員不足5個,表明大熊貓的OR基因家族具有豐富的序列多樣性;诖笮茇、北極熊Ursus maritimus、家犬Canis lupus familiaris和小鼠Mus musculus的OR蛋白序列的多物種聚類分析顯示它們具有267個直系同源基因簇,而大熊貓沒有特有的OR基因,表明其嗅覺特異性不明顯。大熊貓OR基因的數(shù)量明顯比其近親北極熊的少,顯示其在進(jìn)化過程中丟失了大量OR基因,這可能與其食性的顯著改變有關(guān)。
[Abstract]:Olfactory receptor ORs play a key role in odour recognition in olfactory system, and mammalian OR protein is encoded by its largest polygene family. In this study, the OR gene family of giant panda Ailuropoda melanoleuca was analyzed. The results showed that the giant panda had 1,048 OR genes, including 645 complete genes, 219 pseudogenes and 184 fragment genes. The OR genes of the giant panda could be divided into 22 families and 240 subfamilies according to the sequence similarity. The average number of members of each subfamily is less than five, indicating that the OR gene family of the giant panda is rich in sequence diversity. Multispecies cluster analysis of OR protein sequences of polar bear Ursus maritimus, dog Canis lupus familiaris and mouse Mus musculus showed that they had 267 lineal homologous gene clusters, while giant pandas had no specific OR gene. The number of OR genes of giant panda is significantly lower than that of polar bear, which indicates that the giant panda has lost a large number of OR genes during its evolution, which may be related to the significant changes in its eating habits.
【作者單位】: 四川大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【分類號】:Q953
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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本文編號:1641395
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