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斑節(jié)對(duì)蝦Chitinase-2基因的克隆及其在蛻皮和幼體發(fā)育過(guò)程中的表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-03-20 16:18

  本文選題:斑節(jié)對(duì)蝦 切入點(diǎn):幾丁質(zhì)酶 出處:《南方水產(chǎn)科學(xué)》2017年04期  論文類(lèi)型:期刊論文


【摘要】:研究以斑節(jié)對(duì)蝦(Penaeus monodon)轉(zhuǎn)錄組獲得的幾丁質(zhì)酶基因(Pm Chi)片段,運(yùn)用RACE技術(shù)克隆了PmChi基因c DNA全長(zhǎng),命名為PmChi-2。PmChi-2基因c DNA全長(zhǎng)2 050 bp,其中5'-非編碼區(qū)(5'-UTR)144 bp、3'-UTR 319 bp和開(kāi)放閱讀框(ORF)1 587 bp,編碼528個(gè)氨基酸。生物信息學(xué)分析顯示,PmChi-2與其他甲殼動(dòng)物Chi-2的相似性為78%~97%。實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果顯示,PmChi-2在蛻皮前期(D期)表皮中表達(dá)水平最高,在胃、鰓、腹神經(jīng)節(jié)和眼柄中表達(dá)水平依次降低,在其他組織(肝胰腺、腸、肌肉、心臟)中幾乎不表達(dá)。不同蛻皮階段,PmChi-2在鰓、胃和表皮3種組織中的表達(dá)變化模式基本一致,均在蛻皮期(E期)表達(dá)量最低,而最高表達(dá)量在鰓中出現(xiàn)在蛻皮后期(A期),在胃和表皮中為D期。幼體不同發(fā)育階段分析揭示PmChi-2 mRNA在幼體發(fā)育階段的無(wú)節(jié)幼體到糠蝦幼體第二期表達(dá)量維持在一個(gè)低水平,在糠蝦幼體第三期PmChi-2 mRNA表達(dá)水平顯著升高,在仔蝦期又顯著下降,推測(cè)PmChi-2 mRNA可能與斑節(jié)對(duì)蝦幼體發(fā)育密切相關(guān)。研究結(jié)果表明PmChi-2基因可能在斑節(jié)對(duì)蝦蛻皮以及幼體的變態(tài)發(fā)育中發(fā)揮重要作用,為深入研究斑節(jié)對(duì)蝦幾丁質(zhì)酶發(fā)育調(diào)控提供了重要信息。
[Abstract]:The fragment of chitinase gene Pm Chiwas obtained from Penaeus monodon transcriptome, and the full length of PmChi gene c DNA was cloned by RACE technique. The c DNA of PmChi-2.PmChi-2 gene was named as 2 050 BP, of which the 5 PmChi-2.PmChi-2 non-coding region was 144bpt3 + -UTR319 BP and the open reading frame ORFN 1 587 BP, encoding 528 amino acids. Bioinformatics analysis showed that the similarity between PmChi-2 and other crustacean Chi-2 was 78797. The real-time fluorescence was used to determine the similarity between PmChi-2 and other crustaceans. The results of bioinformatics analysis showed that the similarity between PmChi-2 and other crustaceans was 7897. The results of quantitative PCR showed that PmChi-2 expression was the highest in the epidermis of preecdylastic stage D). The expression level in stomach, Gill, ventral ganglion and eye stalk decreased in turn, but hardly in other tissues (hepatopancreas, intestine, muscle, heart). The expression patterns of gastric and epidermal tissues were basically the same, and the expression levels were the lowest in E stage of molting. The highest expression level was found in the Gill at the late stage of decidua and D in the stomach and epidermis. The analysis of the different stages of larval development revealed that the expression of PmChi-2 mRNA was maintained at a low level in the second stage of larval stage from the stage of larval development to that of the second stage of larval stage of furfural shrimp. The expression of PmChi-2 mRNA increased significantly in the third stage of the larvae, and decreased in the larval stage. It is speculated that PmChi-2 mRNA may be closely related to juvenile development of Penaeus vannamei. The results suggest that the PmChi-2 gene may play an important role in the ecdysis and metamorphosis of Penaeus mongolicus. It provides important information for the further study of chitinase regulation of Penaeus Monodon.
【作者單位】: 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院南海水產(chǎn)研究所農(nóng)業(yè)部南海漁業(yè)資源開(kāi)發(fā)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院;
【基金】:現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專(zhuān)項(xiàng)資金(CARS-47) 廣東省省級(jí)科技計(jì)劃項(xiàng)目(2014B020202003) 國(guó)家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)項(xiàng)目(2012AA10A409) 廣東省海洋與漁業(yè)科技推廣專(zhuān)項(xiàng)(A201501A06) 深圳市生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展專(zhuān)項(xiàng)資金現(xiàn)代農(nóng)業(yè)生物產(chǎn)業(yè)推廣扶持計(jì)劃項(xiàng)目(NYSW201400331010053) 海南省應(yīng)用技術(shù)研法與示范推廣專(zhuān)項(xiàng)(ZDXM2015056)
【分類(lèi)號(hào)】:S917.4

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本文編號(hào):1639855


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