泥蚶胰島素生長(zhǎng)因子1受體基因的cDNA全長(zhǎng)克隆及表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2018-03-20 13:02
本文選題:泥蚶 切入點(diǎn):Tg-IGFR基因 出處:《水產(chǎn)學(xué)報(bào)》2017年01期 論文類型:期刊論文
【摘要】:為了研究IGF1R基因在泥蚶生長(zhǎng)、發(fā)育過(guò)程中的調(diào)控作用,本研究基于泥蚶轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)的EST,利用SMART RACE技術(shù)首次克隆獲得泥蚶IGF1R基因(Tg-IGF1R)c DNA全長(zhǎng)序列,該序列全長(zhǎng)為5793 bp,開放閱讀框?yàn)?638 bp,編碼1546個(gè)氨基酸。經(jīng)生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),該基因5′端非編碼區(qū)為810 bp,3′端非編碼區(qū)為345 bp,Tg-IGF1R蛋白分子量為176.01 ku,等電點(diǎn)為6.04,包含4個(gè)Ⅲ型纖粘連蛋白結(jié)構(gòu)域,1個(gè)半胱氨酸富集區(qū)和1個(gè)酪氨酸激酶結(jié)構(gòu)域,屬于親水性跨膜蛋白質(zhì)。氨基酸多重比對(duì)顯示Tg-IGF1R蛋白序列與人、非洲爪蟾、斑馬魚的相似性分別為45.2%、45.6%和45.4%。利用q RT-PCR技術(shù)檢測(cè)了Tg-IGF1R基因在泥蚶成體不同組織及幼體不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)該基因具有廣泛的組織表達(dá)性,在所檢測(cè)的6個(gè)組織(血液、閉殼肌、斧足、鰓、內(nèi)臟團(tuán)和外套膜)中均有不同程度的表達(dá),其中血液中的相對(duì)表達(dá)量最高,并與其余5個(gè)組織間存在顯著性差異,推測(cè)Tg-IGF1R以信號(hào)分子的形式參與多種組織細(xì)胞的生命過(guò)程。Tg-IGF1R基因在泥蚶個(gè)體發(fā)育過(guò)程中的9個(gè)時(shí)期均有表達(dá),且高表達(dá)主要集中在原腸胚期,其次是擔(dān)輪幼蟲期和稚貝期,說(shuō)明Tg-IGF1R基因可能在早期發(fā)育階段參與了某些器官的形成。
[Abstract]:In order to study the role of IGF1R gene in the growth and development of clam clams, the full-length sequence of IGF1R gene Tg-IGF1RG DNA was first cloned by SMART RACE based on the transcriptional library of Clonarca subcrenata. The total length of the sequence is 5793 BP, and the open reading frame is 4638 BP, encoding 1546 amino acids. The 5 '-terminal noncoding region of the gene is 810 BP ~ (3'). The molecular weight of the protein is 176.01 ku. the isoelectric point is 6.04. The protein contains four type 鈪,
本文編號(hào):1639190
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