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泥蚶胰島素生長因子1受體基因的cDNA全長克隆及表達(dá)分析

發(fā)布時間:2018-03-20 13:02

  本文選題:泥蚶 切入點:Tg-IGFR基因 出處:《水產(chǎn)學(xué)報》2017年01期  論文類型:期刊論文


【摘要】:為了研究IGF1R基因在泥蚶生長、發(fā)育過程中的調(diào)控作用,本研究基于泥蚶轉(zhuǎn)錄組文庫的EST,利用SMART RACE技術(shù)首次克隆獲得泥蚶IGF1R基因(Tg-IGF1R)c DNA全長序列,該序列全長為5793 bp,開放閱讀框為4638 bp,編碼1546個氨基酸。經(jīng)生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),該基因5′端非編碼區(qū)為810 bp,3′端非編碼區(qū)為345 bp,Tg-IGF1R蛋白分子量為176.01 ku,等電點為6.04,包含4個Ⅲ型纖粘連蛋白結(jié)構(gòu)域,1個半胱氨酸富集區(qū)和1個酪氨酸激酶結(jié)構(gòu)域,屬于親水性跨膜蛋白質(zhì)。氨基酸多重比對顯示Tg-IGF1R蛋白序列與人、非洲爪蟾、斑馬魚的相似性分別為45.2%、45.6%和45.4%。利用q RT-PCR技術(shù)檢測了Tg-IGF1R基因在泥蚶成體不同組織及幼體不同發(fā)育時期的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)該基因具有廣泛的組織表達(dá)性,在所檢測的6個組織(血液、閉殼肌、斧足、鰓、內(nèi)臟團(tuán)和外套膜)中均有不同程度的表達(dá),其中血液中的相對表達(dá)量最高,并與其余5個組織間存在顯著性差異,推測Tg-IGF1R以信號分子的形式參與多種組織細(xì)胞的生命過程。Tg-IGF1R基因在泥蚶個體發(fā)育過程中的9個時期均有表達(dá),且高表達(dá)主要集中在原腸胚期,其次是擔(dān)輪幼蟲期和稚貝期,說明Tg-IGF1R基因可能在早期發(fā)育階段參與了某些器官的形成。
[Abstract]:In order to study the role of IGF1R gene in the growth and development of clam clams, the full-length sequence of IGF1R gene Tg-IGF1RG DNA was first cloned by SMART RACE based on the transcriptional library of Clonarca subcrenata. The total length of the sequence is 5793 BP, and the open reading frame is 4638 BP, encoding 1546 amino acids. The 5 '-terminal noncoding region of the gene is 810 BP ~ (3'). The molecular weight of the protein is 176.01 ku. the isoelectric point is 6.04. The protein contains four type 鈪,

本文編號:1639190

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