基于線粒體Cyt b基因的蝦夷扇貝群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
本文選題:蝦夷扇貝 切入點:Cyt 出處:《中國水產(chǎn)科學(xué)》2017年03期 論文類型:期刊論文
【摘要】:本研究利用線粒體細胞色素b(Cyt b)基因標記對蝦夷扇貝(Patinopecten yessoensis)6個群體(長島底播增殖群、海洋島底播增殖群、獐子島底播增殖群、旅順自然群、"獐子紅"人工選育群以及日本青森陸奧灣群)進行種質(zhì)狀況評估,研究結(jié)果表明,6個群體120個個體的Cyt b基因序列共檢測到20種單倍型,其中"獐子紅"人工選育群單倍型最少,日本群體單倍型最為豐富,兩者單倍型多樣性指數(shù)分別為0.10000和0.88400。分子方差分析(AMOVA)發(fā)現(xiàn),日本群體與中國群體間變異百分比為15.34%,明顯高于作為一個基因池時群體間遺傳變異水平;就中國組群而言,其83.41%的遺傳變異來自于群體內(nèi)部,組內(nèi)群體間的變異只占1.52%,說明中國群體個體間的遺傳變異遠大于群體間的遺傳變異。F_(st)分析顯示,中國群體與日本群體之間發(fā)生了中等水平的遺傳分化(0.07455~0.17895,Fst0.05)。以遺傳距離矩陣構(gòu)建群體間分子系統(tǒng)樹(UPGMA樹),拓撲結(jié)構(gòu)圖顯示中國5個群體先聚為一支,再與日本群體聚為一支。由此可見,中國養(yǎng)殖區(qū)的蝦夷扇貝與日本原產(chǎn)地群體間已出現(xiàn)明顯的遺傳分化,且蝦夷扇貝中國群體的遺傳多樣性處于較低水平。本研究結(jié)果可為蝦夷扇貝的種質(zhì)資源保護與可持續(xù)開發(fā)利用提供理論依據(jù)。
[Abstract]:In this study, six populations of Patinopecten yessoensis (Patinopecten yessoensis) were identified by mitochondrial cytochrome B cyt (Cyt) gene marker, including long island bottom seeding multiplication group, ocean island bottom seeding multiplication group and Swertia island bottom seeding multiplication group. The results showed that 20 haplotypes were detected in 120 individuals of 6 populations, and 20 haplotypes were detected in 120 individuals of 6 populations. The population haplotypes were the least, and the haplotypes were the most abundant in Japan. The diversity indices of the two haplotypes were 0.10000 and 0.88400, respectively. The results of molecular analysis of variance (AMOVA) showed that. The percentage of variation between Japanese population and Chinese population was 15.34, which was significantly higher than that between populations as a gene pool, and 83.41% of the genetic variation in Chinese population came from within the population. The variation among populations within groups was only 1.52%, which indicated that the genetic variation among individuals in Chinese population was much larger than that among populations. There was a moderate genetic differentiation between Chinese population and Japanese population. The genetic distance matrix was used to construct the molecular phylogenetic tree of UPGMA. The topological map showed that the five populations of China first converged into one branch. From this, we can see that there has been obvious genetic differentiation between the scallop and the population of Japanese origin in the Chinese culture area. The genetic diversity of scallop scallop populations in China is at a low level. The results of this study can provide a theoretical basis for the conservation of germplasm resources and sustainable development and utilization of scallop scallop.
【作者單位】: 上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院;中國水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所;青島海洋科學(xué)與技術(shù)國家實驗室海洋漁業(yè)科學(xué)與食物產(chǎn)出過程功能實驗室;大連海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院;
【基金】:“十二五”農(nóng)村領(lǐng)域國家科技計劃項目(2012BAD18B03) 山東省泰山學(xué)者建設(shè)工程專項
【分類號】:S917.4
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本文編號:1638463
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