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草莓FabHLH3基因克隆表達分析與過量和干涉表達載體的構(gòu)建

發(fā)布時間:2018-03-10 15:28

  本文選題:草莓 切入點:FabHLH 出處:《浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報》2017年02期  論文類型:期刊論文


【摘要】:以八倍體草莓品種越心(Fragaria×ananassa cv.Yuexin)為試材,利用RT-PCR技術(shù)從果實中克隆出FabHLH3基因全長編碼序列,運用生物學(xué)軟件對該序列進行相關(guān)生物信息學(xué)分析,同時采用實時熒光定量PCR方法對FabHLH3基因在不同組織、果實不同發(fā)育階段及不同光質(zhì)處理下的表達模式進行研究。測序和分析結(jié)果表明,FabHLH3基因的CDS全長2 094 bp,編碼697個氨基酸殘基,該蛋白質(zhì)理論分子量約為77.43ku、等電點(p I)為6.05;經(jīng)DNAMAN分析,核苷酸序列和氨基酸序列與二倍體森林草莓(F.vesca)Fvb HLH3基因的一致性分別為92.04%和90.87%。利用實時熒光定量PCR檢測FabHLH3基因在葉、葉柄、花和果實中的表達情況,發(fā)現(xiàn)在葉中的表達量最高,隨著果實發(fā)育,FabHLH3基因表達量逐漸增加,在半紅期達到最高,紅果期開始下降。此外,FabHLH3基因的表達還受到紅光和藍光的誘導(dǎo)。用無縫克隆技術(shù)構(gòu)建了FabHLH3基因的過量表達載體p Green-FabHLH3和干涉表達載體p Green-FabHLH3i,為進一步驗證FabHLH3基因的功能奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Fragaria 脳 ananassa cv. Yuexin, an octaploid strawberry variety, was used to clone the full-length coding sequence of FabHLH3 gene from fruit by RT-PCR technique, and the related bioinformatics analysis was carried out by using biological software. At the same time, real-time fluorescence quantitative PCR was used to detect FabHLH3 gene in different tissues. The results of sequencing and analysis showed that the CDS of FabHLH3 gene was 2094 BP, encoding 697 amino acid residues. The theoretical molecular weight of the protein is about 77.43ku. the isoelectric point (I) is 6.05.The nucleotide sequence and amino acid sequence of the protein are 92.04% and 90.87 respectively consistent with the Fvb gene of the diploid forest strawberry. The real-time fluorescence quantitative PCR was used to detect the FabHLH3 gene in leaves and petioles. The expression of FabHLH3 gene in flower and fruit was the highest in leaves, and increased gradually with the development of fruit, and reached the highest level in semi-red period. In addition, the expression of FabHLH3 gene was induced by red light and blue light. The overexpression vector p Green-FabHLH3 of FabHLH3 gene and the interference vector p Green-FabHLH3i were constructed by seamless cloning, which laid a foundation for further verification of the function of FabHLH3 gene.
【作者單位】: 臨安市農(nóng)林技術(shù)推廣中心;浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝研究所;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(31201613) 浙江省自然科學(xué)基金(LY16C150004)
【分類號】:S668.4

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