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GSTP1基因甲基化檢測(cè)在前列腺癌臨床診斷中的Meta分析

發(fā)布時(shí)間:2018-03-08 22:05

  本文選題:前列腺癌 切入點(diǎn):GSTP 出處:《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》2017年06期  論文類型:期刊論文


【摘要】:谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶-pi 1(glutathione S-transferase pi 1,GSTP1)基因是多種癌癥的抑制基因。目前已有多項(xiàng)研究探討GSTP1基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化檢測(cè)在前列腺癌(prostate cancer,PCa)臨床診斷中的意義,但尚無(wú)系統(tǒng)性評(píng)估。本研究通過(guò)檢索Pub Med、Web of Science數(shù)據(jù)庫(kù),收集相關(guān)英文文獻(xiàn)進(jìn)行Meta分析,對(duì)GSTP1基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化檢測(cè)在PCa臨床診斷中的意義做出系統(tǒng)性評(píng)估。最終有27篇文獻(xiàn),共計(jì)3 183例樣本納入本研究,包含2 067例PCa樣本及1 116例對(duì)照樣本。Meta分析結(jié)果,PCa患者GSTP1基因啟動(dòng)子區(qū)相比正常對(duì)照組呈現(xiàn)顯著高甲基化,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(OR=17.98,95%CI:12.16~26.58,p0.000 1)。不同亞組(人種,樣本類型及檢測(cè)方法等)組間無(wú)顯著性差異。上述研究的合并敏感度及特異度分別為0.70和0.96。此外,我們從TCGA(the cancer genome atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)中選取425例前列腺腺癌(prostate adenocarcinoma,PRAD)組織與54例癌旁組織的高通量全基因組甲基化芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行驗(yàn)證分析后顯示,GSTP1基因啟動(dòng)子區(qū)9個(gè)CpG位點(diǎn)中的7個(gè)位點(diǎn),癌癥組織相比癌旁組織呈現(xiàn)顯著高甲基化水平。其敏感度均在0.85以上,特異度及AUC區(qū)間均在0.90以上,FDR1×10~(-20)。綜上,Meta分析和TCGA均顯示PCa患者GSTP1基因啟動(dòng)子區(qū)相比正常對(duì)照組呈現(xiàn)顯著高甲基化,且診斷特異度與敏感度均較高,是非常有前景的PCa診斷標(biāo)志物,對(duì)PCa的臨床診斷具有借鑒意義。
[Abstract]:Glutathione S-transferase S-transferase 1 (GSTP1) gene is a suppressor gene for many cancers. There have been many studies on the significance of methylation detection of promoter region of GSTP1 gene in the clinical diagnosis of prostate cancer. However, there is no systematic evaluation. In this study, the significance of GSTP1 promoter methylation detection in clinical diagnosis of PCa was systematically evaluated by searching the Pub Med#en1# database and collecting relevant English literature for Meta analysis. There were 27 articles in this study. A total of 3 183 samples were included in this study, including 2 067 PCa samples and 1 116 control samples. The results of Meta-analysis showed that the promoter region of GSTP1 gene in PCA patients was significantly higher than that in normal controls. The difference was statistically significant. There was no significant difference among different subgroups (race, sample type, detection method, etc.). The combined sensitivity and specificity of the above study were 0.70 and 0.96, respectively. High throughput genomic methylation microarray data from 425 prostate adenocarcinoma tissues and 54 adjacent tissues were selected from the TCGA(the cancer genome atlas TCGA database. The results showed that 7 of the 9 CpG loci in the promoter region of the GSTP1 gene were detected. Cancer tissues showed significant hypermethylation levels compared with paracancerous tissues. The sensitivity of cancer tissues was above 0.85. The specificity and the AUC interval were above 0.90. Both meta-analysis and TCGA showed that the promoter region of GSTP1 gene in PCa patients was significantly hypermethylated, and the diagnostic specificity and sensitivity were higher than those in normal controls. It was a promising diagnostic marker for PCa. It is useful for clinical diagnosis of PCa.
【作者單位】: 復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院復(fù)旦大學(xué)消化疾病研究所;
【基金】:國(guó)家科技部973課題(2013CB945401)資助
【分類號(hào)】:R737.25

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本文編號(hào):1585724

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