禽腺病毒4型河南株Hexon全基因的克隆及遺傳進(jìn)化分析
本文選題:禽心包積水-包涵體肝炎綜合征 切入點(diǎn):禽腺病毒型 出處:《西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)》2017年06期 論文類型:期刊論文
【摘要】:【目的】分析禽心包積水-包涵體肝炎綜合征的主要病原禽腺病毒4型(FAV-4)在河南省的流行和遺傳變異情況!痉椒ā繉2015年8-10月送檢的40份疑似FAV-4感染的病料進(jìn)行PCR陽性檢測,同時(shí)根據(jù)采集地區(qū)與宿主的差異性,選取7份FAV-4陽性樣品進(jìn)行了Hexon全基因的擴(kuò)增、克隆、測序和遺傳進(jìn)化分析!窘Y(jié)果】通過擴(kuò)增Hexon基因421bp的片段,成功建立了禽腺病毒4型的PCR檢測方法;40份家禽肝臟樣品中,PCR檢測顯示35份為FAV-4陽性,陽性率為87.5%;成功擴(kuò)增了包含Hexon基因全序列的片段,長度為2 889bp;7株FAV-4河南株的Hexon基因與GenBank中的12株FAV-4參考毒株Hexon基因序列之間核苷酸序列同源性為98.5%~99.8%,與參考株相比存在堿基的插入、突變現(xiàn)象;FAV-4河南株Hexon全基因推導(dǎo)的氨基酸序列與參考株之間的同源性為98.2%~99.8%,且發(fā)生變化的位置集中在前段和中段!窘Y(jié)論】FAV-4河南株與印度分離株親緣關(guān)系較近,但與韓國分離株親緣關(guān)系相對較遠(yuǎn)。
[Abstract]:[objective] to analyze the prevalence and genetic variation of avian adenovirus type 4 (FAV-4) in avian pericardial hydronephrosis and inclusion body hepatitis syndrome. [methods] 40 samples of suspected FAV-4 infection from 2015 to October were tested for PCR positive. At the same time, according to the difference between the region and the host, 7 FAV-4 positive samples were selected for Hexon gene amplification, cloning, sequencing and genetic evolution analysis. [results] by amplifying the 421bp fragment of Hexon gene, A PCR method for detection of avian adenovirus type 4 was successfully established. In 40 samples of poultry liver, 35 samples were positive for FAV-4, the positive rate was 87.5, and the fragment containing the whole sequence of Hexon gene was amplified successfully. The nucleotide sequence homology between the Hexon gene of the Henan strain of FAV-4 and the Hexon gene of the 12 FAV-4 reference strains in GenBank was 98.5 ~ 99.8, and the nucleotide sequence of the Hexon gene of the Henan strain was 98.5 ~ 99.8, compared with the reference strain, the nucleotide sequence was inserted. The amino acid sequence deduced from the whole Hexon gene of FAV-4 Henan strain was 98.2% and 99.8% of the reference strain, and the location of the change was concentrated in the front and middle segments. [conclusion] the relationship between FAV-4 Henan strain and Indian isolate is close, and the amino acid sequence of FAV-4 strain is 98.2% and 99.8% respectively. [conclusion] there is a close relationship between FAV-4 Henan strain and Indian isolate. But the relationship with Korean isolate is relatively distant.
【作者單位】: 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)牧醫(yī)工程學(xué)院;鄭州市豬重大疫病防控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:河南省重大科技專項(xiàng)(111100110300) 河南省產(chǎn)學(xué)研項(xiàng)目(132107000002)
【分類號】:S852.65
【相似文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 趙莉;周潔;高誠;;禽腺病毒載體研究進(jìn)展[J];動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2012年11期
2 周斌,鄭其升,劉華雷,曹瑞兵,陳溥言;禽腺病毒江蘇分離株的細(xì)胞培養(yǎng)特性[J];南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2005年02期
3 劉岳龍,秦愛建,金文杰,崔治中,葉建強(qiáng),王彬,何秀苗;鵝源腺病毒基因組E3區(qū)的鑒定和分析[J];中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào);2005年06期
4 智海東;解生亮;楊志;王云峰;張宇輝;王牟平;孫建宏;陳洪巖;;禽腺病毒Ⅰ型瓊脂擴(kuò)散抗原的研制及應(yīng)用[J];中國獸醫(yī)科學(xué);2009年08期
5 羅思思;謝芝勛;劉加波;謝麗基;龐耀珊;鄧顯文;謝志勤;范晴;彭宜;;Ⅰ群禽腺病毒33K基因的原核表達(dá)與鑒定[J];基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué);2012年01期
6 李梅,李永明,,吳彤,周碧君;禽腺病毒細(xì)胞病變觀察和半數(shù)組織感染量測定[J];貴州農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào);1997年01期
7 劉雪美;秦建如;趙海燕;李育豪;曹偉勝;;Ⅱ群禽腺病毒pⅢa基因的原核表達(dá)及抗原性分析[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2013年23期
8 孫錦;李秋艷;李云龍;黃兵;宋敏訓(xùn);李新華;;禽腺病毒QU株一個(gè)復(fù)制非必需區(qū)的鑒定[J];生物工程學(xué)報(bào);2008年07期
9 羅思思;謝芝勛;劉加波;謝麗基;龐耀珊;鄧顯文;謝志勤;范晴;彭宜;;Ⅰ群禽腺病毒100K蛋白主要抗原區(qū)基因片段的表達(dá)及鑒定[J];西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2012年05期
10 謝芝勛,MazharI.Khan;應(yīng)用PCR檢測禽腺病毒[J];中國獸醫(yī)學(xué)報(bào);2000年04期
相關(guān)會議論文 前5條
1 唐熠;謝芝勛;劉加波;龐耀珊;鄧顯文;謝志勤;謝麗基;;Ⅰ群禽腺病毒四種核酸檢測方法的比較[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會禽病學(xué)分會第十五次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2010年
2 章金剛;李茂祥;金奇;向華;杜華茂;胡敬東;侯云德;殷震;;禽腺病毒的分子生物學(xué)及載體構(gòu)建[A];面向21世紀(jì)的科技進(jìn)步與社會經(jīng)濟(jì)發(fā)展(下冊)[C];1999年
3 唐熠;謝芝勛;劉加波;龐耀珊;鄧顯文;謝志勤;謝麗基;;Ⅰ群禽腺病毒環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測方法的建立[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會禽病學(xué)分會第十五次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2010年
4 李海英;尹燕博;郭妍妍;王曉紅;王守春;;Ⅰ群禽腺病毒12個(gè)血清型毒株Hexon蛋白全基因序列測定與分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會禽病學(xué)分會第十五次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2010年
5 劉岳龍;秦愛建;金文杰;崔治中;葉建強(qiáng);王彬;何秀苗;;鵝源腺病毒基因組E3區(qū)的鑒定和分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會禽病學(xué)分會第十一次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2002年
相關(guān)博士學(xué)位論文 前3條
1 張明明;Ⅰ群禽腺病毒的分離鑒定和生物學(xué)特性研究及重組禽腺病毒的構(gòu)建[D];揚(yáng)州大學(xué);2008年
2 何秀苗;禽腺病毒載體的構(gòu)建及其生物學(xué)特性的研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2004年
3 黃兵;表達(dá)禽流感病毒H5血凝素禽腺病毒重組體的構(gòu)建及其特性研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條
1 陳雪姣;Ⅰ群禽腺病毒湖北株的分離鑒定及致病性研究[D];長江大學(xué);2016年
2 邱麗葉;禽腺病毒熒光定量PCR檢測方法的建立與初步應(yīng)用[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年
3 陳天驁;血清4型禽腺病毒GX2013毒株的生物學(xué)特性鑒定和檢測方法的建立[D];揚(yáng)州大學(xué);2016年
4 王小輝;Ⅰ群禽腺病毒的分離鑒定及其生物學(xué)特性研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2008年
5 國紀(jì)壘;I群禽腺病毒山東株的分離鑒定及其致病性研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年
6 武敏;Ⅰ群禽腺病毒JS株Ⅲa蛋白的原核表達(dá)及其單克隆抗體的研制[D];揚(yáng)州大學(xué);2009年
7 韋悠;Ⅰ群禽腺病毒滅活油乳劑苗的研究[D];廣西大學(xué);2011年
8 張科;重組禽腺病毒JS-eGFP的生物學(xué)特性與致病性研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2005年
9 羅思思;Ⅰ群禽腺病毒分離鑒定及重組蛋白ELISA鑒別診斷方法的研究[D];廣西大學(xué);2011年
10 文艷玲;禽腺病毒hexon基因克隆表達(dá)及間接ELISA和熒光PCR檢測方法的建立[D];廣西大學(xué);2008年
本文編號:1581540
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/1581540.html