鐵皮石斛可溶性酸性轉(zhuǎn)化酶基因克隆與表達(dá)分析
本文選題:鐵皮石斛 切入點(diǎn):酸性轉(zhuǎn)化酶 出處:《華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年02期 論文類型:期刊論文
【摘要】:【目的】克隆鐵皮石斛Dendrobium officinale可溶性酸性轉(zhuǎn)化酶基因SAI,分析該基因生物學(xué)信息及時(shí)空表達(dá)特異性!痉椒ā炕谕葱蛄锌寺¤F皮石斛SAI基因c DNA全長(zhǎng),采用生物信息學(xué)方法進(jìn)行序列分析,并采用qRTPCR進(jìn)行組織特異性表達(dá)分析。【結(jié)果】鐵皮石斛SAI基因全長(zhǎng)為1 595 bp,c DNA編碼區(qū)1 368 bp,Genbank登錄號(hào)為KU598852。該基因編碼455個(gè)氨基酸,蛋白相對(duì)分子質(zhì)量為50 700。NCBI BLASTx分析表明,該基因氨基酸序列與柑橘Citrus unshiu酸性轉(zhuǎn)化酶基因、甜橙C.sinensis酸性β-呋喃果糖苷酶基因序列相似性最高,達(dá)77%,與其他植物酸性轉(zhuǎn)化酶基因的相似性均高于68%。聚類分析表明,鐵皮石斛SAI基因與玉米Zea mays液泡轉(zhuǎn)化酶基因、甘蔗Saccharum officinarum SAI基因親緣關(guān)系最近。該基因編碼的蛋白質(zhì)屬于非跨膜結(jié)構(gòu)的親水性熱穩(wěn)定蛋白,定位于液泡中。SAI基因在2年生鐵皮石斛的莖中表達(dá)量最高,3年生的葉中表達(dá)量最低。【結(jié)論】成功克隆鐵皮石斛液泡酸性轉(zhuǎn)化酶基因,該基因在鐵皮石斛不同組織不同生育時(shí)期的表達(dá)量差異較大。
[Abstract]:[objective] to clone the soluble acid invertase gene of Dendrobium officinale from Dendrobium candidum and analyze its biological information and spatio-temporal expression specificity. [methods] based on the homologous sequence, the full length of c DNA of SAI gene of Dendrobium candidum was cloned. Sequence analysis was carried out by bioinformatics, and tissue specific expression was analyzed by qRTPCR. [results] the total length of SAI gene of Dendrobium candidum was 1 595 BP C DNA coding region 1 368 BP Genbank accession number was KU598852. The gene encodes 455 amino acids. The protein molecular weight was 50,700.NCBI BLASTx analysis showed that the amino acid sequence of this gene was the most similar to that of Citrus unshiu acid invertase gene and C. sinensis acid 尾 -furan fructosidase gene. The similarity with other plant acid invertase genes was higher than 68. Cluster analysis showed that the SAI gene of Dendrobium candidum and the Zea mays vacuolar invertase gene of maize were higher than those of other plants. The Saccharum officinarum SAI gene of sugarcane is closely related. The protein encoded by this gene belongs to the hydrophilic thermostable protein with non-transmembrane structure. The expression of SAI gene was the highest in the stems of 2-year-old Dendrobium candidum and the lowest in the leaves of 3-year old Dendrobium candidum. [conclusion] the vacuolar acid invertase gene of Dendrobium candidum was cloned successfully. The expression of this gene in different tissues of Dendrobium candidum was different in different growth stages.
【作者單位】: 云南省高校農(nóng)作物優(yōu)質(zhì)高效栽培與安全控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/紅河學(xué)院生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【分類號(hào)】:S828
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,本文編號(hào):1578796
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