本文選題：豬流行性腹瀉病毒　切入點：S基因　出處：《浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報》2017年03期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為調(diào)查近年來浙江省豬流行性腹瀉病毒流行毒株與疫苗株的S基因和ORF3基因遺傳變異情況,2011—2016年,從浙江省各地區(qū)采集疑似豬流行性腹瀉病料并提取其RNA,用3對特異性引物對S基因和ORF3基因進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增、克隆及測序,并對其序列變化、遺傳進(jìn)化情況和抗原位點進(jìn)行分析。結(jié)果表明:與國內(nèi)疫苗株CV777相比,12個樣品株的S基因存在15個核苷酸插入和6個核苷酸缺失,導(dǎo)致氨基酸序列存在5個氨基酸插入(~(58)QGVN~(61)和~(140)N)和2個氨基酸缺失(~(163)DI~(164)),且在主要突變區(qū)S1區(qū)的2個中和表位(499-638和764-771 aa)有8處氨基酸突變;樣品株的ORF3基因有7處氨基酸變異。遺傳進(jìn)化分析結(jié)果顯示,12株分離株的S基因與亞洲主要疫苗株(國內(nèi)疫苗株CV777和韓國弱毒疫苗株DR13)的同源性僅為93.3%~94.9%,而與2011—2016年中國流行株(BJ-2011和Hu N)的同源性高達(dá)97.8%~99.9%,表明近年來豬流行性腹瀉病毒呈現(xiàn)較大程度的變異,可為研制更加有效的疫苗奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to investigate the genetic variation of S gene and ORF3 gene of epidemic and vaccine strains of porcine epidemic diarrhea virus in Zhejiang Province in recent years, Suspected porcine epidemic diarrhea materials were collected from Zhejiang Province and their RNAs were extracted. The S and ORF3 genes were amplified by RT-PCR, cloned, sequenced and sequenced with 3 pairs of specific primers. Genetic evolution and antigenic sites were analyzed. The results showed that there were 15 nucleotide insertions and 6 nucleotide deletions in S gene of 12 strains compared with domestic vaccine strains CV777. The results showed that there were 5 amino acid insertions in the amino acid sequence, 1) and 140N) and 2 amino acid deletions, and 8 amino acid mutations were found in the two neutralization epitopes of S1 region (49-638 and 764-771 aa). There were 7 amino acid mutations in the ORF3 gene of the sample strain. The results of genetic evolution analysis showed that the S gene of 12 strains was only 93.3% 94.9 homology with the major Asian vaccine strains (domestic vaccine CV777 and Korean attenuated virus strain DR13), but only 93.3% 94.9 with 2011-2016. The homology of Chinese epidemic strains BJ-2011 and Hu Nis as high as 97.8% and 99.9%, indicating that the swine epidemic diarrhea virus has shown a large degree of variation in recent years. It can lay the foundation for the development of a more effective vaccine.
【作者單位】： 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院;浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所;
【基金】：公益技術(shù)研究農(nóng)業(yè)項目(2015C32028,2016C32072)
【分類號】：S852.65

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