遼寧省朝陽市細粒棘球病的基因型分析
本文關鍵詞: 細粒棘球蚴 cox基因 基因型 分子流行病學 出處:《中國人獸共患病學報》2017年02期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的分析本院分離到的人源性棘球蚴的基因型,為遼寧省棘球蚴病的分子流行病學提供資料。方法經(jīng)外科手術方法從患者肝內(nèi)獲取棘球蚴囊,將囊內(nèi)容物離心沉淀提取DNA,以細粒棘球絳蟲線粒體細胞色素氧化酶(cox1)基因為靶基因設計引物進行PCR擴增,對PCR產(chǎn)物進行測序,測序結果應用Blast進行分析,并與GenBank數(shù)據(jù)庫中序列進行比對。結果 cox1擴增產(chǎn)物及測序的結果提示,本例樣本與細粒棘球幼的cox1基因型(AF297617)高度相似,差異性為0.1%,基因型屬于G1亞型。并與其他國家的25個分離株序列一致。結論線粒體基因組的cox1基因分析是棘球蚴病診斷和分型的有力工具。遼寧地區(qū)首次報道了細粒棘球絳蟲的基因型為G1亞型,其序列與國內(nèi)外的多個分離株保持一致,為棘球蚴病的分子流行病學補充了資料。
[Abstract]:Objective to analyze the genotypes of human echinococci isolated from our hospital and to provide data for molecular epidemiology of echinococcosis in Liaoning Province. The DNA was extracted by centrifugation precipitation from the capsule contents. The PCR products were amplified by PCR using the mitochondrial cytochrome oxidase cox1) as the target gene of Echinococcus granulosus. The PCR products were sequenced. The results were analyzed by Blast. Results the results of cox1 amplification and sequencing showed that the sample was highly similar to the cox1 genotype AF297617 of young spinous granulosus. The difference is 0.1 and the genotype belongs to G1 subtype. It is consistent with 25 isolates from other countries. Conclusion cox1 gene analysis of mitochondrial genome is a powerful tool for diagnosis and typing of echinococcosis. The genotype of Echinococcus granulosus was G1 subtype. The sequence is consistent with many isolates at home and abroad, which provides additional data for molecular epidemiology of echinococcosis.
【作者單位】: 中國醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院內(nèi)分泌科內(nèi)分泌研究所遼寧省內(nèi)分泌疾病重點實驗室;中國醫(yī)科大學塔城醫(yī)院消化內(nèi)分泌科;中國醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院病原生物學教研室;
【基金】:國家自然科學基金(No.81370189);國家自然科學基金青年基金(No.81302271)聯(lián)合資助~~
【分類號】:R532.32
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