本文關(guān)鍵詞： 紅掌 SOC基因 生物信息學(xué) 表達(dá)分析　出處：《浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版)》2017年03期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為了明確SOC1轉(zhuǎn)錄因子在紅掌中的成員及作用機(jī)制,采用5'/3'末端快速擴(kuò)增技術(shù)獲得這2個(gè)SOC1基因的完整編碼區(qū),通過生物信息學(xué)軟件分析這2個(gè)基因的相關(guān)信息,并結(jié)合熒光定量反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)驗(yàn)證這2個(gè)基因的表達(dá)模式。結(jié)果顯示:獲得的2個(gè)基因核苷酸長度分別為651 bp和642 bp,命名為Aa SOC1-1和Aa SOC1-2;2個(gè)轉(zhuǎn)錄因子在二級(jí)結(jié)構(gòu)上均有螺旋、折疊和轉(zhuǎn)角,未發(fā)現(xiàn)其他結(jié)構(gòu)。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,二者與單子葉植物同類蛋白距離較近,與紅掌的植物學(xué)分類地位一致。表達(dá)分析結(jié)果顯示,2個(gè)基因均在營養(yǎng)器官和生殖器官中表達(dá),但表達(dá)水平略有差異。研究認(rèn)為,從紅掌中克隆的2個(gè)SOC1轉(zhuǎn)錄因子可能定位于線粒體而非細(xì)胞核中,二者在序列組成和表達(dá)模式上既有保守性也存在一定的差異性,預(yù)示它們?cè)诠δ苌峡赡芤泊嬖谝欢ǖ膮^(qū)別。
[Abstract]:In order to clarify the membership and mechanism of SOC1 transcription factors in the palm of red palm, the complete coding regions of the two SOC1 genes were obtained by rapid amplification of 5 / 3 'terminal, and the related information of the two genes was analyzed by bioinformatics software. The expression patterns of these two genes were confirmed by fluorescence quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction. The results showed that the nucleotide lengths of the two genes were 651bp and 642bprespectively, named AA SOC1-1 and AaSOC1-2. There are helix in the secondary structure, No other structures were found at folding and turning angles. Phylogenetic analysis showed that they were closer to monocotyledonous proteins. The results of expression analysis showed that the two genes were expressed in vegetative and reproductive organs, but the level of expression was slightly different. The two SOC1 transcription factors cloned from the red palm may be located in the mitochondria but not in the nucleus. There are both conserved and different sequence composition and expression patterns between them, indicating that there may be some differences in their functions.
【作者單位】： 浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院花卉研究開發(fā)中心;浙江省杭州蕭山技師學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31200527) 浙江省農(nóng)業(yè)新品種選育重大專項(xiàng)(2016C02056-13)
【分類號(hào)】：Q943.2;S682.14

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本文編號(hào)：1544824