湖南部分地區(qū)豬鏈球菌SAO蛋白基因的分子流行病學(xué)調(diào)查
本文關(guān)鍵詞: 豬鏈球菌 流行病學(xué)調(diào)查 PCR SAO蛋白 出處:《湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)》2016年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:本研究參考GenBank上公布的豬鏈球菌序列,針對(duì)SAO蛋白基因序列設(shè)計(jì)了檢測(cè)引物,并命名為SAO-D,所擴(kuò)增的目的條帶大小為400bp。為了同時(shí)能成功區(qū)分SAO蛋白基因不同變異體和鑒定SAO蛋白基因缺失,針對(duì)SAO蛋白全長(zhǎng)設(shè)計(jì)了特異性引物,并命名為SAO-FL,所擴(kuò)增的目的條帶大小根據(jù)的SAO蛋白基因的變異情況不一而有區(qū)別。其中分別能擴(kuò)增大、中、小三種大小片段的目的條帶,SAO-L條帶大小為2500bp左右,SAO-M條帶大小為2000bp左右,SAO-S條帶大小為1700bp左右。SAO蛋白基因缺失菌株能成功擴(kuò)增300bp的目的條帶。本實(shí)驗(yàn)室一共分離并保存了318株豬鏈球菌,有269株能成功鑒定血清型,共涵蓋的血清型25個(gè)。對(duì)269株豬鏈球菌進(jìn)行檢測(cè),發(fā)現(xiàn)血清型16型所有菌株無(wú)法檢測(cè)到SAO蛋白基因,同時(shí)在血清型2型、8型、9型、15型、28型、31型也有部分菌株無(wú)法檢測(cè)到SAO蛋白基因。能成功檢測(cè)到SAO蛋白基因的菌株243株,占總檢測(cè)量的90.3%,SAO蛋白基因缺失的菌株26株,占總檢測(cè)量9.7%。在所有能成功檢測(cè)到SAO蛋白基因的豬鏈球菌中,SAO-M為SAO蛋白基因主要存在方式,共192株,占總檢測(cè)量的79%,SAO-L共18株,檢測(cè)率為7.4%,SAO-S檢出率最少,僅7株,檢測(cè)率為2.9%,還有部分樣品依靠SAO-FL無(wú)法成功分型,共26株,占總檢測(cè)量的10.7%。由此可見(jiàn),SAO蛋白在豬鏈球菌中普遍存在,并且在SAO蛋白的諸多變異體中,SAO-M是最常見(jiàn)的變異體。
[Abstract]:SAO - M was identified as SAO - D , and the SAO - M band was about 2000 bp . The SAO - M band was about 2000 bp .
【學(xué)位授予單位】:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S852.611
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1523080
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