本文關(guān)鍵詞： 間日瘧原蟲 裂殖子表面蛋白 多態(tài)性　出處：《中國(guó)寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志》2017年01期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的分析云南省輸入性及本地感染間日瘧病例的瘧原蟲裂殖子表面蛋白1(Plasmodium vivax merozoite surface protein-1,Pv MSP-1)基因5區(qū)序列及其等位基因的多態(tài)性。方法 2012年8月-2015年9月,收集云南省輸入性及本地感染間日瘧病例的濾紙血樣和流行病學(xué)史等相關(guān)信息。提取瘧原蟲DNA,PCR擴(kuò)增Pv MSP-1基因5區(qū)并測(cè)序,與M75674、AAN86237、M60807、ABJ53045、AAN86238、BAA18977等參比序列進(jìn)行比對(duì),用Mega 5.04、Arlequin3.5.1軟件分析Pv MSP-1基因5區(qū)的序列多態(tài)性,計(jì)算序列間保守位點(diǎn)、遺傳距離和多樣性指數(shù),并根據(jù)氨基酸序列間的遺傳距離繪制聚類樹狀圖。結(jié)果 2012年8月-2015年9月,共收集間日瘧病例血樣847份。其中,云南省本地感染61份,非洲、緬甸感染的分別為66和720份。847份血樣中278份擴(kuò)增出Pv MSP-1基因5區(qū)片段,206份測(cè)序成功。Pv MSP-1基因5區(qū)片段編碼氨基酸長(zhǎng)193~222 aa。氨基酸序列比對(duì)分析顯示,Sal-1、Belem和Recombine基因型分別占59.2%(122/206)、23.3%(48/206)和17.5%(36/206),緬甸、非洲感染和云南本地感染血樣中Sal-1基因型分別占58.8%(104/177)、11/15和7/14。Sal-1、Belem、Recombine基因型分別有51、9和6個(gè)亞型。這66個(gè)亞型的Shannon-wiener指數(shù)(H’)和期望雜合度(He)分別為0.955和0.567。206條DNA序列的同源位點(diǎn)為665 bp、保守位點(diǎn)為11.3%(75/665)、變異位點(diǎn)為88.7%(590/665),不同感染來(lái)源地的分離株與不同的氨基酸參比序列的遺傳距離均小于0.4。聚類分析顯示,206條Pv MSP-1基因5區(qū)氨基酸序列按基因型聚類成2個(gè)大類,有3個(gè)次級(jí)分支,其中,Recombine與Belem基因型的相似度為91%~92%,高于與Sal-1基因型的82%~83%。結(jié)論云南省輸入性及本地感染的間日瘧原蟲分離株P(guān)v MSP-1基因5區(qū)存在多種亞型,在Sal-1、Belem、Recombine等3種基因型中,Sal-1型占優(yōu)勢(shì)。
[Abstract]:Objective to analyze the sequence and allele polymorphism of Plasmodium vivax merozoite surface protein-1 PvMSP-1) gene in Plasmodium vivax merozoite surface protein-1PvMSP-1 gene of Plasmodium vivax and Plasmodium merozoite surface protein-1in imported and locally infected Plasmodium vivax malaria cases from August 2012 to September 2015 in Yunnan Province. The paper blood samples and epidemiological history of imported and locally infected Plasmodium vivax malaria cases in Yunnan Province were collected. The Pv MSP-1 gene region 5 was amplified by PCR from Plasmodium falciparum DNA and sequenced, and compared with the reference sequence of A75674 AAN86237 M60807 ABJ53045 AAN86238BAA18977. Mega 5.04 Arlequin3.5.1 software was used to analyze the polymorphism of PV MSP-1 gene region 5, to calculate the conserved loci, genetic distance and diversity index between sequences, and to draw a cluster tree map according to the genetic distance between amino acid sequences. A total of 847 blood samples were collected from vivax malaria cases. Two hundred and eighty-six out of 66 and 720 blood samples from Myanmar were infected with PV MSP-1 gene. Two hundred and six samples were sequenced successfully. The amino acid length of the 5 region fragment of the PV MSP-1 gene was 1993 ~ (aaa). The analysis of amino acid sequence comparison showed that Sal-1Bel and Recombine genotypes were detected by comparison of amino acid sequences. Don't take 59.2% 122.2 / 206 / 23.3t / 206) and 17.5a / 36R / 206b, Burma, In the blood samples of African infection and Yunnan native infection, the proportion of Sal-1 genotypes in 104 / 177G / 11 / 15 and 7 / 14 / Sal-1Bel / Recombine genotypes were 51 / 9 and 6, respectively. The Shannon-wiener index and expected heterozygosity of the 66 subtypes were 0.955 and 0.567.206 DNA homologous sites, respectively. 665 BP, the conserved site was 11.3% / 665N, the mutation site was 88.70.90 / 665N, and the genetic distance between the isolated strains from different infection sources and different amino acid reference sequences was less than 0.4. Cluster analysis showed that the amino acid sequences of the 5 region of Pv MSP-1 gene were clustered into two groups according to genotype. There were three secondary branches, among which the similarity between Recombine and Belem genotype was 91 / 92, which was higher than that with Sal-1 genotype. Conclusion there are many subtypes in Pv MSP-1 gene region 5 of P. vivax isolates isolated from Yunnan Province. The Sal-1 genotype was dominant in three genotypes, such as Sal-1 Belemer Recombine and so on.
【作者單位】： 云南省寄生蟲病防治所云南省瘧疾研究中心云南省蟲媒傳染病防控研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;大理大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(No.81220108019,81660559) 上海市2015年度科技創(chuàng)新行動(dòng)計(jì)劃(No.15495800400)~~
【分類號(hào)】：R382.31

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本文編號(hào)：1516137