谷子蔗糖合成酶基因家族鑒定及生物信息學(xué)分析
本文關(guān)鍵詞: 谷子 蔗糖合成酶 SiSuS基因 生物信息學(xué)分析 蛋白結(jié)構(gòu) 出處:《江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué)》2017年15期 論文類型:期刊論文
【摘要】:蔗糖合成酶(sucrose synthase,SuS)是蔗糖代謝的關(guān)鍵酶,在植物的代謝反應(yīng)中起重要作用。以谷子基因組數(shù)據(jù)庫為平臺,借用生物信息學(xué)手段對谷子SiSuS基因家族進行挖掘和分析。結(jié)果表明,谷子的SiSuS基因家族包括9個基因,它們不均勻地分布在5條染色體上。該家族氨基酸序列長度為809~1 088 aa,外顯子數(shù)目為10~16個,大多數(shù)蛋白質(zhì)為弱酸性。谷子SiSuS的氨基酸序列具有9個保守基序;進化樹分析結(jié)果表明,谷子、水稻、高粱SiSuS蛋白聚在一起。
[Abstract]:Sucrose synthase Sus is the key enzyme of sucrose metabolism and plays an important role in plant metabolic response. The SiSuS gene family of millet was excavated and analyzed by bioinformatics on the platform of millet genome database. The SiSuS gene family of millet consists of 9 genes, which are unevenly distributed on 5 chromosomes. The amino acid sequence of the family is 809 (1088aa) and the number of exons is 10 ~ 16. Most of the proteins were weakly acidic. The amino acid sequences of millet SiSuS had 9 conserved motifs, and the results of evolutionary tree analysis showed that the SiSuS proteins of millet, rice and sorghum were clustered together.
【作者單位】: 河北北方學(xué)院;河北省沽源縣農(nóng)牧局;河北省農(nóng)林科學(xué)院谷子研究所;
【基金】:國家科技重大專項(編號:2014ZX0800909B) 河北省科技廳項目(編號:16226310D) 河北北方學(xué)院重大項目(編號:ZD201305)
【分類號】:S515
【相似文獻】
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,本文編號:1511466
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